More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2234 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2234  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000004842  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2316  rubredoxin  64.71 
 
 
56 aa  75.5  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7103  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0091  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.75 
 
 
54 aa  74.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94635  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.67 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.78 
 
 
55 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.552989  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1377  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.78 
 
 
55 aa  72.8  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
53 aa  72.8  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0782  rubredoxin  55.77 
 
 
53 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3447  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.67 
 
 
58 aa  72  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  58 
 
 
229 aa  72  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0238  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.57 
 
 
56 aa  72  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.24657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3222  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.72 
 
 
52 aa  72  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.798538  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0605  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.71 
 
 
54 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0064851  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0680  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.75 
 
 
56 aa  71.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7086  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3194  rubredoxin  60.78 
 
 
52 aa  71.6  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 
56 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.75 
 
 
55 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5224  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.75 
 
 
55 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.573132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1135  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.57 
 
 
57 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74035  normal  0.399177 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0768  rubredoxin  53.85 
 
 
53 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0260  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.39 
 
 
56 aa  71.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.75 
 
 
55 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5602  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.78 
 
 
55 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.681813  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0158  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.78 
 
 
55 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1284  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.56 
 
 
53 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000469047  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3672  rubredoxin  63.27 
 
 
57 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459184  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3972  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.39 
 
 
50 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5029  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.82 
 
 
55 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.651986  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4855  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.78 
 
 
54 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  0.0694189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3286  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.86 
 
 
63 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552771  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0205  RubA  60 
 
 
81 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.6 
 
 
53 aa  69.3  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3191  rubredoxin  69.57 
 
 
50 aa  68.9  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.423634  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2796  rubredoxin  58 
 
 
53 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.50585e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.78 
 
 
55 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02387  hypothetical protein  58 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0900  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.39 
 
 
57 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.837679 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1052  rubredoxin  53.85 
 
 
52 aa  68.6  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  56 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
444 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54 
 
 
476 aa  68.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.82 
 
 
54 aa  68.6  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698268  hitchhiker  0.00824609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.82 
 
 
55 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.492346 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56 
 
 
455 aa  68.2  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2624  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.39 
 
 
56 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  60.78 
 
 
477 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.86 
 
 
53 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.23 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.86 
 
 
53 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.87 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0668  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64 
 
 
64 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00929106  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.92 
 
 
53 aa  67.8  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5441  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.82 
 
 
72 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0604584  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2048  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.77 
 
 
52 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59994e-22 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2480  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.9 
 
 
52 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3173  rubredoxin  62 
 
 
91 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3171  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.54 
 
 
52 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000167353  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.86 
 
 
54 aa  67.4  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2175  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.77 
 
 
52 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81123  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3592  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.78 
 
 
55 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3579  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.57 
 
 
50 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0406077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2902  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.57 
 
 
50 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.152091  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0101  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
52 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000330254  hitchhiker  1.93244e-16 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4627  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.39 
 
 
56 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
52 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5474  rubredoxin  58.82 
 
 
55 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1492  hypothetical protein  62 
 
 
58 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1491  hypothetical protein  62 
 
 
58 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1190  putative rubredoxin protein  56.86 
 
 
54 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1200  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.86 
 
 
54 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196829  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0014  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56 
 
 
52 aa  66.2  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.25088  normal  0.171003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2418  RubB protein  54.9 
 
 
55 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1352  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.42 
 
 
59 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.726116 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3687  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.04 
 
 
59 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3080  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.98 
 
 
54 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.3234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4719  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.42 
 
 
60 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  58.82 
 
 
461 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6127  rubredoxin  56.86 
 
 
55 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.02 
 
 
54 aa  65.9  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0111  rubredoxin  60 
 
 
57 aa  65.9  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0380  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0735  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026428  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70630  rubredoxin 2  56.86 
 
 
55 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0862  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2083  rubredoxin  60 
 
 
57 aa  65.9  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0752  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.765216  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3151  rubredoxin  62 
 
 
56 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1999  rubredoxin  62 
 
 
56 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3960  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 
56 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1460  rubredoxin  62 
 
 
56 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2330  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 
56 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0569406 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0914  rubredoxin  62 
 
 
56 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4069  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.94 
 
 
53 aa  65.5  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000133148  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2744  rubredoxin  62 
 
 
56 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0833  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 
56 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0206003  hitchhiker  0.0000319456 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3115  rubredoxin  62 
 
 
56 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0203  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.94 
 
 
52 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>