More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1377 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1377  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
55 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  69.09 
 
 
461 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0680  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  72.73 
 
 
56 aa  93.2  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.91 
 
 
55 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2316  rubredoxin  75.93 
 
 
56 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3286  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.37 
 
 
63 aa  90.5  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552771  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  72.73 
 
 
55 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5224  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  72.73 
 
 
55 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.573132 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  61.82 
 
 
477 aa  90.5  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  72.73 
 
 
55 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6127  rubredoxin  70.91 
 
 
55 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70630  rubredoxin 2  70.91 
 
 
55 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5474  rubredoxin  70.91 
 
 
55 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6128  rubredoxin 1  70.91 
 
 
55 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70640  rubredoxin 1  70.91 
 
 
55 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0158  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.91 
 
 
55 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4855  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.37 
 
 
54 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  0.0694189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.27 
 
 
55 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.492346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5602  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.27 
 
 
55 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.681813  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5029  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.27 
 
 
55 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.651986  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2418  RubB protein  66.67 
 
 
55 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0091  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.37 
 
 
54 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3592  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.45 
 
 
55 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02387  hypothetical protein  64.15 
 
 
70 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4627  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.04 
 
 
56 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529245  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3672  rubredoxin  69.39 
 
 
57 aa  84  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459184  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.27 
 
 
56 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.81 
 
 
55 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.552989  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3173  rubredoxin  62.26 
 
 
91 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1780  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.15 
 
 
63 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.322429  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1851  rubredoxin  64.15 
 
 
63 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.67 
 
 
62 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3687  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.15 
 
 
59 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484857  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13279  rubredoxin rubB  70.37 
 
 
60 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610704  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2526  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.15 
 
 
56 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.81 
 
 
54 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698268  hitchhiker  0.00824609 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0605  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.81 
 
 
54 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0064851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0752  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 
70 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.765216  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0788  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.71 
 
 
56 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0380  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 
70 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4719  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  68.52 
 
 
60 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0735  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 
70 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0862  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 
70 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1190  putative rubredoxin protein  66.67 
 
 
54 aa  80.5  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7103  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.15 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1200  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.67 
 
 
54 aa  80.5  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196829  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3952  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 
61 aa  80.5  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.336788 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1352  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  68.52 
 
 
59 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.726116 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3115  rubredoxin  62.26 
 
 
56 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0866  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 
56 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0534026  normal  0.223756 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1999  rubredoxin  62.26 
 
 
56 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2330  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 
56 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0569406 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3960  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 
56 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2083  rubredoxin  62.96 
 
 
57 aa  80.1  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3151  rubredoxin  62.26 
 
 
56 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0914  rubredoxin  62.26 
 
 
56 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0833  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 
56 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0206003  hitchhiker  0.0000319456 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1460  rubredoxin  62.26 
 
 
56 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2744  rubredoxin  62.26 
 
 
56 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0111  rubredoxin  62.96 
 
 
57 aa  80.1  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0667  rubredoxin protein  62.26 
 
 
60 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 
60 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.319433  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3355  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.54 
 
 
57 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862516  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0611  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 
60 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672431  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2748  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.64 
 
 
62 aa  79.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.39 
 
 
480 aa  79.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1135  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.54 
 
 
57 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74035  normal  0.399177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3813  rubredoxin  60.38 
 
 
56 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131702  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1744  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.67 
 
 
60 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.49 
 
 
57 aa  79  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133358  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2068  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 
56 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.190541 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0260  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.38 
 
 
56 aa  79  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2688  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.92 
 
 
54 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.243531  normal  0.0572068 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0602  rubredoxin  57.41 
 
 
58 aa  78.2  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3710  putative rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7086  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.38 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0668  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.38 
 
 
64 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00929106  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0238  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.49 
 
 
56 aa  77.8  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.24657  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  61.54 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0205  RubA  62.26 
 
 
81 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0900  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.38 
 
 
57 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.837679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2624  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.38 
 
 
56 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1492  hypothetical protein  59.26 
 
 
58 aa  76.6  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1491  hypothetical protein  59.26 
 
 
58 aa  76.6  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3191  rubredoxin  65.31 
 
 
50 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.423634  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3629  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.6 
 
 
64 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3447  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.26 
 
 
58 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1134  rubredoxin  63.46 
 
 
67 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0691  rubredoxin  63.46 
 
 
67 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1142  rubredoxin  63.46 
 
 
67 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2089  rubredoxin  63.46 
 
 
67 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2205  rubredoxin  63.46 
 
 
60 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2523  rubredoxin  63.46 
 
 
60 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.58 
 
 
476 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.78 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537464  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58 
 
 
415 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2127  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.62 
 
 
58 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.44 
 
 
445 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2234  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.78 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000004842  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.78 
 
 
60 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>