More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0916 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
100 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537464  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5702  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  98.33 
 
 
60 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1751  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  96.67 
 
 
60 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2399  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  88.06 
 
 
70 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  96.67 
 
 
60 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  70.24 
 
 
105 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2282  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  95 
 
 
60 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1134  rubredoxin  88.33 
 
 
67 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0691  rubredoxin  88.33 
 
 
67 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2089  rubredoxin  88.33 
 
 
67 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1142  rubredoxin  88.33 
 
 
67 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2205  rubredoxin  88.33 
 
 
60 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2523  rubredoxin  88.33 
 
 
60 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1202  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  82.76 
 
 
63 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3342  putative rubredoxin  82.76 
 
 
63 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7103  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49 
 
 
140 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2127  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  78.95 
 
 
58 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7086  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  76.36 
 
 
137 aa  103  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0205  RubA  76.36 
 
 
81 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3710  putative rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  74.07 
 
 
179 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66 
 
 
480 aa  90.5  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3629  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60 
 
 
64 aa  90.1  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3952  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.3 
 
 
61 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.336788 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3173  rubredoxin  51.85 
 
 
91 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0866  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.45 
 
 
56 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0534026  normal  0.223756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3813  rubredoxin  63.64 
 
 
56 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131702  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2526  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.64 
 
 
56 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  56.6 
 
 
461 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0380  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.82 
 
 
70 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2068  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.11 
 
 
56 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.190541 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0735  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.82 
 
 
70 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0862  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.82 
 
 
70 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0752  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.82 
 
 
70 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.765216  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0914  rubredoxin  61.82 
 
 
56 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1999  rubredoxin  61.82 
 
 
56 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3960  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.82 
 
 
56 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3115  rubredoxin  61.82 
 
 
56 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1460  rubredoxin  61.82 
 
 
56 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2744  rubredoxin  61.82 
 
 
56 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3151  rubredoxin  61.82 
 
 
56 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0833  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.82 
 
 
56 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0206003  hitchhiker  0.0000319456 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2330  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.82 
 
 
56 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0569406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0667  rubredoxin protein  53.33 
 
 
60 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.33 
 
 
60 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.319433  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.54 
 
 
415 aa  82  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0611  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.33 
 
 
60 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672431  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.24 
 
 
455 aa  79.7  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0668  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.49 
 
 
64 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00929106  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2624  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.49 
 
 
56 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.57 
 
 
476 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02387  hypothetical protein  54.84 
 
 
70 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3687  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
59 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484857  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0260  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.38 
 
 
56 aa  77.4  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.26 
 
 
62 aa  76.6  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  53.85 
 
 
477 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.49 
 
 
55 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3286  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.18 
 
 
63 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552771  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0238  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.49 
 
 
56 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.24657  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2418  RubB protein  56.6 
 
 
55 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1492  hypothetical protein  52.63 
 
 
58 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1491  hypothetical protein  52.63 
 
 
58 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1135  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.63 
 
 
57 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74035  normal  0.399177 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.67 
 
 
54 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698268  hitchhiker  0.00824609 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1377  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.78 
 
 
55 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.82 
 
 
55 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2554  rubredoxin protein  53.45 
 
 
60 aa  74.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.82 
 
 
55 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5224  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.82 
 
 
55 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.573132 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0900  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.63 
 
 
57 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.837679 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2626  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.41 
 
 
65 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5029  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.6 
 
 
55 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.651986  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0158  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.86 
 
 
55 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4627  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.72 
 
 
56 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529245  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.18 
 
 
444 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.69 
 
 
53 aa  72.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4069  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.62 
 
 
53 aa  72  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000133148  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.18 
 
 
444 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5602  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.72 
 
 
55 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.681813  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3592  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
55 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
55 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.492346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1284  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.5 
 
 
53 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000469047  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3355  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.12 
 
 
57 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862516  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  50 
 
 
227 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1190  putative rubredoxin protein  59.18 
 
 
54 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.62 
 
 
56 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1200  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.18 
 
 
54 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196829  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3579  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58 
 
 
50 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0406077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2902  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58 
 
 
50 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.152091  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3447  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.7 
 
 
58 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6127  rubredoxin  56.6 
 
 
55 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70630  rubredoxin 2  56.6 
 
 
55 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.92 
 
 
55 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.552989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.18 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1052  rubredoxin  62.75 
 
 
52 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144051  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5474  rubredoxin  52.83 
 
 
55 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1649  rubrerythrin  59.18 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429351 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  50 
 
 
589 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.54 
 
 
444 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2013  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52 
 
 
56 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  37.04 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>