More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2282 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2282  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
60 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2399  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  98.33 
 
 
70 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525804  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1751  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  98.33 
 
 
60 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  98.33 
 
 
60 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  95 
 
 
100 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537464  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5702  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  93.33 
 
 
60 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  90 
 
 
105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0691  rubredoxin  88.33 
 
 
67 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2089  rubredoxin  88.33 
 
 
67 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1134  rubredoxin  88.33 
 
 
67 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1142  rubredoxin  88.33 
 
 
67 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2205  rubredoxin  88.33 
 
 
60 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2523  rubredoxin  88.33 
 
 
60 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2127  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  78.95 
 
 
58 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1202  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  76.19 
 
 
63 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3342  putative rubredoxin  76.19 
 
 
63 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7086  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  72.73 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7103  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.09 
 
 
140 aa  93.6  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0205  RubA  72.73 
 
 
81 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3710  putative rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.37 
 
 
179 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3952  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.33 
 
 
61 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.336788 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 
480 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3629  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.67 
 
 
64 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0866  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.71 
 
 
56 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0534026  normal  0.223756 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2068  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.18 
 
 
56 aa  78.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.190541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  52.83 
 
 
461 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3173  rubredoxin  57.14 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2526  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.93 
 
 
56 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3813  rubredoxin  58.93 
 
 
56 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131702  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.69 
 
 
415 aa  77  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0914  rubredoxin  57.14 
 
 
56 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0667  rubredoxin protein  51.67 
 
 
60 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1999  rubredoxin  57.14 
 
 
56 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0611  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.67 
 
 
60 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672431  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3960  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
56 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2330  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
56 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0569406 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2744  rubredoxin  57.14 
 
 
56 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1460  rubredoxin  57.14 
 
 
56 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0380  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
70 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3151  rubredoxin  57.14 
 
 
56 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305413  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.67 
 
 
60 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.319433  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0752  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
70 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.765216  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0833  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
56 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0206003  hitchhiker  0.0000319456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0735  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
70 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0862  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
70 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3115  rubredoxin  57.14 
 
 
56 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.18 
 
 
444 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.26 
 
 
62 aa  73.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.85 
 
 
455 aa  73.9  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.18 
 
 
444 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  54 
 
 
589 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6127  rubredoxin  60.38 
 
 
55 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2418  RubB protein  56.6 
 
 
55 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0668  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.7 
 
 
64 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00929106  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70630  rubredoxin 2  60.38 
 
 
55 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2624  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.7 
 
 
56 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2554  rubredoxin protein  51.67 
 
 
60 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2626  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.41 
 
 
65 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1377  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.78 
 
 
55 aa  72  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320132  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0260  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.56 
 
 
56 aa  71.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4627  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.79 
 
 
56 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529245  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02387  hypothetical protein  47.46 
 
 
70 aa  70.9  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
444 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.85 
 
 
476 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3687  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.7 
 
 
59 aa  70.5  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484857  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0238  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.7 
 
 
56 aa  70.5  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.24657  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1492  hypothetical protein  52.73 
 
 
58 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1491  hypothetical protein  52.73 
 
 
58 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.09 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.94 
 
 
445 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2688  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.62 
 
 
54 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.243531  normal  0.0572068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3355  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.37 
 
 
57 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862516  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.72 
 
 
55 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.09 
 
 
57 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133358  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3286  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.77 
 
 
63 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552771  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0608  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.82 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.128184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0439  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.82 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1135  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.37 
 
 
57 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74035  normal  0.399177 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.6 
 
 
54 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698268  hitchhiker  0.00824609 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.9 
 
 
55 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5224  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.9 
 
 
55 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.573132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.9 
 
 
55 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5474  rubredoxin  52.83 
 
 
55 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0788  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.04 
 
 
56 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6128  rubredoxin 1  52.83 
 
 
55 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0139  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.42 
 
 
53 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.43807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0158  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.94 
 
 
55 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0900  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
57 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.837679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70640  rubredoxin 1  52.83 
 
 
55 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.85 
 
 
53 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4069  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.77 
 
 
53 aa  65.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000133148  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1649  rubrerythrin  55.1 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429351 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0680  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.94 
 
 
56 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3592  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
55 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.17 
 
 
469 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.77 
 
 
56 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5029  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
55 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.651986  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1284  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.33 
 
 
53 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000469047  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1780  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.61 
 
 
63 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.322429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1534  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.42 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477082  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>