More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1534 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1534  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
69 aa  141  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477082  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  61.7 
 
 
227 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  54.72 
 
 
589 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56 
 
 
237 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56 
 
 
237 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2533  rubrerythrin  58 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.17 
 
 
480 aa  66.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0875  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.33 
 
 
52 aa  65.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2282  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.42 
 
 
60 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1751  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.42 
 
 
60 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.42 
 
 
60 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  57.45 
 
 
229 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.32 
 
 
444 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2399  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.42 
 
 
70 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525804  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.17 
 
 
284 aa  64.7  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48 
 
 
476 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5441  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.85 
 
 
72 aa  63.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0604584  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.32 
 
 
444 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1649  rubrerythrin  56 
 
 
238 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429351 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
455 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2418  RubB protein  58.7 
 
 
55 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1931  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0090  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.7 
 
 
52 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
444 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1254  rubredoxin  55.1 
 
 
56 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3672  rubredoxin  52.08 
 
 
57 aa  61.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459184  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  53.06 
 
 
243 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6127  rubredoxin  53.19 
 
 
55 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70630  rubredoxin 2  53.19 
 
 
55 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.25 
 
 
100 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537464  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
60 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232754  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  55.32 
 
 
237 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3080  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
54 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.3234  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  52.17 
 
 
461 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5702  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.17 
 
 
60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
55 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2626  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.52 
 
 
65 aa  59.3  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0866  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
56 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0534026  normal  0.223756 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.57 
 
 
53 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000285186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3173  rubredoxin  50 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4627  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
56 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.33 
 
 
53 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  54.17 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1377  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320132  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4069  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.57 
 
 
53 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000133148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2526  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
56 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2688  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.32 
 
 
54 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.243531  normal  0.0572068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2127  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
58 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2089  rubredoxin  52.08 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0139  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.25 
 
 
53 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.43807 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1999  rubredoxin  48.94 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2205  rubredoxin  52.08 
 
 
60 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0238  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.35 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.24657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1134  rubredoxin  52.08 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2330  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0569406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0833  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0206003  hitchhiker  0.0000319456 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3960  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0260  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.35 
 
 
56 aa  58.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0691  rubredoxin  52.08 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3151  rubredoxin  48.94 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305413  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0677  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52 
 
 
53 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000269222  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3115  rubredoxin  48.94 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1460  rubredoxin  48.94 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.15 
 
 
415 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3813  rubredoxin  48.94 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131702  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0914  rubredoxin  48.94 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2523  rubredoxin  52.08 
 
 
60 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2744  rubredoxin  48.94 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1142  rubredoxin  52.08 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27651  rubredoxin  53.06 
 
 
53 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.17 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0667  rubredoxin protein  52.17 
 
 
60 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.45 
 
 
52 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0752  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.765216  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.17 
 
 
60 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.319433  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0611  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.17 
 
 
60 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672431  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3355  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
57 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862516  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0608  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.128184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
445 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0680  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
56 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0380  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
52 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0735  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0862  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
57 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133358  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2554  rubredoxin protein  53.19 
 
 
60 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1284  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
53 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000469047  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0439  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
172 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.06 
 
 
53 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.06 
 
 
53 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1537  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.06 
 
 
237 aa  57.4  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0402296  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2796  rubredoxin  57.45 
 
 
53 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.50585e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.64 
 
 
469 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0602  rubredoxin  51.06 
 
 
58 aa  57  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3952  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.35 
 
 
61 aa  57  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.336788 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3710  putative rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.08 
 
 
179 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.06 
 
 
52 aa  57  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
52 aa  57  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.403873  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1457  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.06 
 
 
58 aa  57  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>