More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1511 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  99.16 
 
 
237 aa  490  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
237 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1649  rubrerythrin  70.59 
 
 
238 aa  353  1e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  69.2 
 
 
237 aa  349  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2533  rubrerythrin  70.94 
 
 
237 aa  345  3e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1537  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.82 
 
 
237 aa  333  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0402296  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  67.95 
 
 
243 aa  332  2e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.09 
 
 
235 aa  332  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0679  Rubrerythrin  43.02 
 
 
164 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1376  rubrerythrin  45.28 
 
 
161 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.642256  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0090  rubrerythrin  43.4 
 
 
160 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4854  rubrerythrin  41.98 
 
 
165 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.836415  normal  0.0724585 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2317  rubrerythrin/nigerythrin-like protein  45.34 
 
 
157 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.761634 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  33.94 
 
 
167 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  33.63 
 
 
164 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  42.34 
 
 
146 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  31.56 
 
 
164 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  43.8 
 
 
146 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0059  rubrerythrin  36.31 
 
 
156 aa  95.5  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0465733  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  39.88 
 
 
140 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  31.11 
 
 
164 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  33.78 
 
 
166 aa  92.8  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  40 
 
 
140 aa  92.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  40.74 
 
 
140 aa  92.4  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  39.02 
 
 
168 aa  92.4  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  42.07 
 
 
140 aa  91.7  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  30.63 
 
 
166 aa  91.7  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  91.7  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  39.51 
 
 
140 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  31.08 
 
 
165 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  39.51 
 
 
140 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  30.18 
 
 
165 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  37.95 
 
 
143 aa  90.9  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  45 
 
 
139 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  32.74 
 
 
166 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  33.93 
 
 
165 aa  90.1  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  31.98 
 
 
166 aa  89.7  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  31.08 
 
 
166 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  32.29 
 
 
165 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0677  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.31 
 
 
53 aa  87.8  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000269222  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  41.5 
 
 
139 aa  87.8  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0217  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.62 
 
 
58 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  38.41 
 
 
139 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  29.91 
 
 
165 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  30.63 
 
 
166 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  30.63 
 
 
166 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  32 
 
 
164 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  30.73 
 
 
166 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  40.15 
 
 
144 aa  86.7  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  32.43 
 
 
166 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  32.14 
 
 
165 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  31.53 
 
 
166 aa  87  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  31.98 
 
 
166 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  29.39 
 
 
181 aa  86.3  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1978  rubredoxin-like  56.6 
 
 
76 aa  85.9  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000953598  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  30.18 
 
 
166 aa  85.5  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  30.04 
 
 
166 aa  85.5  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  31.11 
 
 
165 aa  85.5  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  31.14 
 
 
179 aa  85.1  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0147  rubredoxin  65.96 
 
 
52 aa  85.1  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  30.53 
 
 
165 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  29 
 
 
190 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  36.97 
 
 
139 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  38.41 
 
 
140 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  30.36 
 
 
169 aa  84.7  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  30.18 
 
 
166 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  29.69 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  29.6 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  28.07 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  30.7 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  34.73 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.93 
 
 
60 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232754  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  30.36 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  41.73 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  41.73 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.46 
 
 
53 aa  82.8  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.46 
 
 
53 aa  82.8  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  41.73 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  30.28 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  41.43 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.41 
 
 
480 aa  80.9  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  33.03 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0875  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.75 
 
 
52 aa  81.3  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000124351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  38.93 
 
 
139 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.56 
 
 
455 aa  81.6  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3930  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.54 
 
 
53 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186647 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.5 
 
 
53 aa  81.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0847  rubredoxin  56 
 
 
52 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  32.29 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>