More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0439 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0439  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
172 aa  352  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0608  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  96.51 
 
 
172 aa  311  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.128184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0441  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.68 
 
 
177 aa  197  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5440  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  73.58 
 
 
72 aa  94.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366792  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0442  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.059171  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.38 
 
 
415 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1370  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.81 
 
 
53 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5738  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.38 
 
 
54 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13280  rubredoxin rubA  72 
 
 
55 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.789329  normal  0.716019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1351  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.04 
 
 
53 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359999  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1334  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.04 
 
 
53 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.93 
 
 
476 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2749  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66 
 
 
53 aa  79.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5441  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.34 
 
 
72 aa  78.2  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0604584  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1743  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64 
 
 
57 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884753  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4720  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.38 
 
 
57 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70630  rubredoxin 2  64.15 
 
 
55 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6127  rubredoxin  64.15 
 
 
55 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0603  hypothetical protein  61.4 
 
 
63 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402214 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02387  hypothetical protein  51.61 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.54 
 
 
480 aa  74.7  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 
62 aa  74.3  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.26 
 
 
469 aa  74.3  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.46 
 
 
56 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4212  Alkane 1-monooxygenase  63.27 
 
 
470 aa  72.4  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56 
 
 
455 aa  72.4  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  54.72 
 
 
477 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  56.6 
 
 
105 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7103  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
444 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2554  rubredoxin protein  50.98 
 
 
60 aa  69.7  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3952  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.6 
 
 
61 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.336788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.72 
 
 
444 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.72 
 
 
444 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3286  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.7 
 
 
63 aa  68.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552771  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0122  alkane 1-monooxygenase  57.69 
 
 
481 aa  69.3  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174684  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.72 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3173  rubredoxin  50 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6128  rubredoxin 1  56.6 
 
 
55 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0205  RubA  45.95 
 
 
81 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.72 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70640  rubredoxin 1  56.6 
 
 
55 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7086  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.07 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0680  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
56 aa  68.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2626  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.85 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.18 
 
 
60 aa  68.2  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232754  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0602  rubredoxin  50.94 
 
 
58 aa  68.2  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.7 
 
 
445 aa  67.8  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2282  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.82 
 
 
60 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1751  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.82 
 
 
60 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2399  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.6 
 
 
70 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.82 
 
 
60 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13279  rubredoxin rubB  58.49 
 
 
60 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610704  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0752  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
70 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.765216  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3710  putative rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0380  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
70 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0735  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
70 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0862  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
70 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1492  hypothetical protein  52.83 
 
 
58 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1491  hypothetical protein  52.83 
 
 
58 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  56.6 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
54 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.6 
 
 
54 aa  67  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698268  hitchhiker  0.00824609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2330  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
56 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0569406 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1999  rubredoxin  50.94 
 
 
56 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0914  rubredoxin  50.94 
 
 
56 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3960  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
56 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1460  rubredoxin  50.94 
 
 
56 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2744  rubredoxin  50.94 
 
 
56 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3115  rubredoxin  50.94 
 
 
56 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3151  rubredoxin  50.94 
 
 
56 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305413  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.11 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537464  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0833  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
56 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0206003  hitchhiker  0.0000319456 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1978  rubredoxin-like  39.44 
 
 
76 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000953598  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.92 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2089  rubredoxin  50 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3592  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
55 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3813  rubredoxin  50.94 
 
 
56 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131702  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1134  rubredoxin  50 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1142  rubredoxin  50 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0691  rubredoxin  50 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2205  rubredoxin  56.6 
 
 
60 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2526  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
56 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.85 
 
 
55 aa  65.1  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.552989  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1649  rubrerythrin  45.59 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0668  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.06 
 
 
64 aa  65.5  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00929106  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2523  rubredoxin  56.6 
 
 
60 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0866  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
56 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0534026  normal  0.223756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2624  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.06 
 
 
56 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.72 
 
 
55 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.7 
 
 
53 aa  64.7  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0158  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
55 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
55 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
55 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223368 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2316  rubredoxin  51.92 
 
 
56 aa  63.9  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4627  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
56 aa  63.9  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529245  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
55 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.492346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5224  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
55 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.573132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0667  rubredoxin protein  45.61 
 
 
60 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.61 
 
 
60 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.319433  normal  0.961099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>