More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0122 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4212  Alkane 1-monooxygenase  70.15 
 
 		 470 aa  699    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0122  alkane 1-monooxygenase  100 
 
 		 481 aa  985    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5739  Alkane 1-monooxygenase  63.02 
 
 		 390 aa  504  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1369  alkane 1-monooxygenase  57.95 
 
 		 407 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1742  alkane 1-monooxygenase  56.72 
 
 		 423 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.967304  normal  0.913807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4721  alkane 1-monooxygenase  57.65 
 
 		 410 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2750  Alkane 1-monooxygenase  55.72 
 
 		 420 aa  458  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3100  alkane 1-monooxygenase  57.52 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1333  alkane 1-monooxygenase  57.38 
 
 		 411 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1350  alkane 1-monooxygenase  57.38 
 
 		 411 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4221  Alkane 1-monooxygenase  53.39 
 
 		 387 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4109  Alkane 1-monooxygenase  53.39 
 
 		 387 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.491081  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4085  alkane 1-monooxygenase  54.29 
 
 		 386 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64023  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5401  Alkane 1-monooxygenase  53.44 
 
 		 384 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0125234  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1208  alkane 1-monooxygenase  53.7 
 
 		 384 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000710132  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0501  alkane-1 monooxygenase  54.29 
 
 		 384 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.070399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0941  alkane 1-monooxygenase  54.74 
 
 		 386 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0980  alkane 1-monooxygenase  54.29 
 
 		 384 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13281  transmembrane alkane 1-monooxygenase alkB  52.74 
 
 		 416 aa  420  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.863568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1373  Alkane 1-monooxygenase  56.6 
 
 		 403 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.935228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0560  Alkane 1-monooxygenase  54.01 
 
 		 398 aa  418  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2678  alkane-1 monooxygenase  52.91 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2801  alkane-1 monooxygenase  52.91 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0853  alkane 1-monooxygenase  53.39 
 
 		 386 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.743087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2735  alkane-1 monooxygenase  52.91 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3369  alkane 1-monooxygenase  57.06 
 
 		 398 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0635  alkane-1 monooxygenase  52.91 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1692  alkane-1 monooxygenase  52.91 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2377  alkane-1 monooxygenase  52.91 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1814  alkane-1 monooxygenase  53.48 
 
 		 388 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2910  alkane-1 monooxygenase  52.91 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0419518  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0841  alkane 1-monooxygenase  53.12 
 
 		 386 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767136  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2192  alkane 1-monooxygenase  52.66 
 
 		 420 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1251  alkane 1-monooxygenase  51.57 
 
 		 409 aa  388  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2843  alkane 1-monooxygenase  48.86 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0606  alkane 1-monooxygenase  45.01 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127289 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0610  alkane 1-monooxygenase  45.6 
 
 		 406 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0440  alkane 1-monooxygenase  45.6 
 
 		 407 aa  355  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.560557  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5439  alkane 1-monooxygenase  45.22 
 
 		 403 aa  348  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2418  alkane 1-monooxygenase  59.3 
 
 		 286 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0357839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0443  alkane 1-monooxygenase  44.47 
 
 		 401 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2053  alkane 1-monooxygenase  47.58 
 
 		 410 aa  339  8e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3068  hypothetical protein  39.33 
 
 		 355 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2925  hypothetical protein  40.98 
 
 		 355 aa  266  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2750  alkane 1-monooxygenase  42.14 
 
 		 377 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.149414  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3808  alkane hydroxylase  40.41 
 
 		 377 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44700  alkane-1-monooxygenase 2  40.91 
 
 		 377 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0109557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30810  alkane-1-monooxygenase  41.28 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00688507  hitchhiker  0.000000000018165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2642  hypothetical protein  41.06 
 
 		 382 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2098  alkane 1-monooxygenase  41.54 
 
 		 380 aa  219  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.512673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0027  alkane 1-monooxygenase  38.2 
 
 		 384 aa  216  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.114958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2646  alkane 1-monooxygenase  38.82 
 
 		 380 aa  206  6e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0394  alkane 1-monooxygenase  37.22 
 
 		 377 aa  204  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0065  alkane 1-monooxygenase  36.77 
 
 		 425 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446257  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1467  alkane 1-monooxygenase  35.21 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0118  alkane 1-monooxygenase  35.49 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0516319  normal  0.119168 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1262  alkane 1-monooxygenase  31.2 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2541  fatty acid desaturase  37.92 
 
 		 387 aa  159  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00838464  hitchhiker  0.00025026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1222  alkane 1-monooxygenase  36.6 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.93 
 
 		 752 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1213  alkane 1-monooxygenase  31.95 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1639  fatty acid desaturase domain-containing protein  32.47 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157574  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2903  fatty acid desaturase  25.14 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.410754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4720  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.83 
 
 		 57 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1743  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  68.75 
 
 		 57 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3561  p-cymene monooxygenase, hydroxylase subunit(CymAa)  25.07 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13280  rubredoxin rubA  62.5 
 
 		 55 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.789329  normal  0.716019 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3845  fatty acid desaturase  25.35 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1370  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.5 
 
 		 53 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5738  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.58 
 
 		 54 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0608  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.69 
 
 		 172 aa  69.3  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.128184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2749  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.78 
 
 		 53 aa  68.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0439  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.69 
 
 		 172 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0442  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.3 
 
 		 132 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.059171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1334  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.33 
 
 		 53 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1351  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.33 
 
 		 53 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359999  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5477  alkane 1-monooxygenase  22.31 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.354466 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0603  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  67  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0441  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 		 177 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5440  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.02 
 
 		 72 aa  63.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1780  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.7 
 
 		 63 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.322429  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1851  rubredoxin  58.7 
 
 		 63 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1377  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.7 
 
 		 55 aa  60.5  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320132  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3672  rubredoxin  51.92 
 
 		 57 aa  59.3  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0091  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.17 
 
 		 54 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.17 
 
 		 62 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55 
 
 		 52 aa  57.4  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.52 
 
 		 55 aa  57  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13279  rubredoxin rubB  54.35 
 
 		 60 aa  57  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610704  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.41 
 
 		 52 aa  57  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 		 56 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02387  hypothetical protein  55.56 
 
 		 70 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.08 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3191  rubredoxin  57.78 
 
 		 50 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.423634  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4855  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.33 
 
 		 54 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  0.0694189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2688  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.97 
 
 		 54 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.243531  normal  0.0572068 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 		 53 aa  55.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.33 
 
 		 54 aa  55.1  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 		 53 aa  55.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>