66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4221 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4221  Alkane 1-monooxygenase  100 
 
 		 387 aa  797    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4109  Alkane 1-monooxygenase  100 
 
 		 387 aa  797    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.491081  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0501  alkane-1 monooxygenase  76.33 
 
 		 384 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.070399  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4085  alkane 1-monooxygenase  75.53 
 
 		 386 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64023  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0980  alkane 1-monooxygenase  76.33 
 
 		 384 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0941  alkane 1-monooxygenase  76.33 
 
 		 386 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5401  Alkane 1-monooxygenase  74.15 
 
 		 384 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0125234  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0853  alkane 1-monooxygenase  74.16 
 
 		 386 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.743087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0841  alkane 1-monooxygenase  74.73 
 
 		 386 aa  597  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767136  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1208  alkane 1-monooxygenase  73.89 
 
 		 384 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000710132  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2735  alkane-1 monooxygenase  76.2 
 
 		 388 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2678  alkane-1 monooxygenase  76.2 
 
 		 388 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1814  alkane-1 monooxygenase  76.27 
 
 		 388 aa  588  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2801  alkane-1 monooxygenase  76.2 
 
 		 388 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2910  alkane-1 monooxygenase  75.94 
 
 		 388 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0419518  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2377  alkane-1 monooxygenase  75.94 
 
 		 388 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1692  alkane-1 monooxygenase  75.94 
 
 		 388 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0635  alkane-1 monooxygenase  75.94 
 
 		 388 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2418  alkane 1-monooxygenase  79.43 
 
 		 286 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0357839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4721  alkane 1-monooxygenase  55.78 
 
 		 410 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1742  alkane 1-monooxygenase  55.3 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.967304  normal  0.913807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1369  alkane 1-monooxygenase  54.5 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5739  Alkane 1-monooxygenase  55.85 
 
 		 390 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2750  Alkane 1-monooxygenase  53.27 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1333  alkane 1-monooxygenase  53.96 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1350  alkane 1-monooxygenase  53.96 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4212  Alkane 1-monooxygenase  51.58 
 
 		 470 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0122  alkane 1-monooxygenase  53.39 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2843  alkane 1-monooxygenase  52.41 
 
 		 433 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13281  transmembrane alkane 1-monooxygenase alkB  52.75 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.863568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0560  Alkane 1-monooxygenase  53.02 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1251  alkane 1-monooxygenase  54.55 
 
 		 409 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3100  alkane 1-monooxygenase  49.47 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2192  alkane 1-monooxygenase  52.21 
 
 		 420 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2053  alkane 1-monooxygenase  50.41 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1373  Alkane 1-monooxygenase  51.61 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.935228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3369  alkane 1-monooxygenase  50.42 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0443  alkane 1-monooxygenase  47.06 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0610  alkane 1-monooxygenase  45.92 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0440  alkane 1-monooxygenase  45.92 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.560557  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5439  alkane 1-monooxygenase  44.94 
 
 		 403 aa  345  8.999999999999999e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0606  alkane 1-monooxygenase  41.73 
 
 		 400 aa  342  5e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127289 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3068  hypothetical protein  43.18 
 
 		 355 aa  301  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2925  hypothetical protein  43.2 
 
 		 355 aa  294  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2750  alkane 1-monooxygenase  45.48 
 
 		 377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.149414  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44700  alkane-1-monooxygenase 2  47.34 
 
 		 377 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0109557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3808  alkane hydroxylase  47.34 
 
 		 377 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2642  hypothetical protein  43.77 
 
 		 382 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30810  alkane-1-monooxygenase  43.77 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00688507  hitchhiker  0.000000000018165 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2098  alkane 1-monooxygenase  38.66 
 
 		 380 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.512673 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2646  alkane 1-monooxygenase  38.76 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0027  alkane 1-monooxygenase  38.68 
 
 		 384 aa  202  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.114958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0394  alkane 1-monooxygenase  36.23 
 
 		 377 aa  199  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0065  alkane 1-monooxygenase  33.14 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446257  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1467  alkane 1-monooxygenase  34.71 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0118  alkane 1-monooxygenase  34.41 
 
 		 423 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0516319  normal  0.119168 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1262  alkane 1-monooxygenase  36.8 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2541  fatty acid desaturase  34.34 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00838464  hitchhiker  0.00025026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1222  alkane 1-monooxygenase  30.47 
 
 		 400 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.12 
 
 		 752 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1213  alkane 1-monooxygenase  30.32 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1639  fatty acid desaturase domain-containing protein  35.68 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157574  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3845  fatty acid desaturase  28.81 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2903  fatty acid desaturase  26.43 
 
 		 376 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.410754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3561  p-cymene monooxygenase, hydroxylase subunit(CymAa)  26.58 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5477  alkane 1-monooxygenase  26.28 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.354466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>