67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2418 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2418  alkane 1-monooxygenase  100 
 
 
286 aa  587  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0357839  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0941  alkane 1-monooxygenase  93.36 
 
 
386 aa  553  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0980  alkane 1-monooxygenase  93.71 
 
 
384 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0501  alkane-1 monooxygenase  93.71 
 
 
384 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.070399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0853  alkane 1-monooxygenase  92.31 
 
 
386 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.743087  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4085  alkane 1-monooxygenase  92.63 
 
 
386 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64023  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0841  alkane 1-monooxygenase  91.96 
 
 
386 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767136  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5401  Alkane 1-monooxygenase  84.53 
 
 
384 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0125234  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1814  alkane-1 monooxygenase  86.43 
 
 
388 aa  501  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1208  alkane 1-monooxygenase  85.25 
 
 
384 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000710132  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0635  alkane-1 monooxygenase  85 
 
 
388 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1692  alkane-1 monooxygenase  85 
 
 
388 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2735  alkane-1 monooxygenase  85 
 
 
388 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2678  alkane-1 monooxygenase  85 
 
 
388 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2910  alkane-1 monooxygenase  85 
 
 
388 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0419518  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2377  alkane-1 monooxygenase  85 
 
 
388 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2801  alkane-1 monooxygenase  85 
 
 
388 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4221  Alkane 1-monooxygenase  79.43 
 
 
387 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4109  Alkane 1-monooxygenase  79.43 
 
 
387 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.491081  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1742  alkane 1-monooxygenase  64.62 
 
 
423 aa  388  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.967304  normal  0.913807 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2750  Alkane 1-monooxygenase  64.07 
 
 
420 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4721  alkane 1-monooxygenase  63.37 
 
 
410 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1369  alkane 1-monooxygenase  64.1 
 
 
407 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1333  alkane 1-monooxygenase  63.9 
 
 
411 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1350  alkane 1-monooxygenase  63.9 
 
 
411 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13281  transmembrane alkane 1-monooxygenase alkB  62.28 
 
 
416 aa  368  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.863568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5739  Alkane 1-monooxygenase  60.14 
 
 
390 aa  355  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2843  alkane 1-monooxygenase  58.96 
 
 
433 aa  354  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0122  alkane 1-monooxygenase  59.3 
 
 
481 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174684  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2053  alkane 1-monooxygenase  59.85 
 
 
410 aa  336  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2192  alkane 1-monooxygenase  61.57 
 
 
420 aa  335  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0560  Alkane 1-monooxygenase  57.45 
 
 
398 aa  332  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4212  Alkane 1-monooxygenase  54.9 
 
 
470 aa  331  7.000000000000001e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3100  alkane 1-monooxygenase  56.88 
 
 
396 aa  326  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1251  alkane 1-monooxygenase  62.65 
 
 
409 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1373  Alkane 1-monooxygenase  61.29 
 
 
403 aa  322  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.935228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3369  alkane 1-monooxygenase  58.96 
 
 
398 aa  298  7e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5439  alkane 1-monooxygenase  48.75 
 
 
403 aa  285  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186555  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0610  alkane 1-monooxygenase  48.34 
 
 
406 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0443  alkane 1-monooxygenase  48.38 
 
 
401 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319502  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0440  alkane 1-monooxygenase  48.34 
 
 
407 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.560557  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0606  alkane 1-monooxygenase  47.31 
 
 
400 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127289 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2925  hypothetical protein  47.01 
 
 
355 aa  268  8.999999999999999e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3068  hypothetical protein  47.21 
 
 
355 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2750  alkane 1-monooxygenase  50.94 
 
 
377 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.149414  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44700  alkane-1-monooxygenase 2  50.97 
 
 
377 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0109557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3808  alkane hydroxylase  50.97 
 
 
377 aa  248  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30810  alkane-1-monooxygenase  47.37 
 
 
382 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00688507  hitchhiker  0.000000000018165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2642  hypothetical protein  47.91 
 
 
382 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2098  alkane 1-monooxygenase  46.88 
 
 
380 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.512673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0027  alkane 1-monooxygenase  44.62 
 
 
384 aa  204  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.114958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2646  alkane 1-monooxygenase  45.34 
 
 
380 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0394  alkane 1-monooxygenase  44.72 
 
 
377 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0065  alkane 1-monooxygenase  41.04 
 
 
425 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446257  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0118  alkane 1-monooxygenase  42.52 
 
 
423 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0516319  normal  0.119168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1467  alkane 1-monooxygenase  42.13 
 
 
423 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1262  alkane 1-monooxygenase  39.66 
 
 
400 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2541  fatty acid desaturase  40.08 
 
 
387 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00838464  hitchhiker  0.00025026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1222  alkane 1-monooxygenase  37.65 
 
 
400 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1213  alkane 1-monooxygenase  34.07 
 
 
415 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.21 
 
 
752 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1639  fatty acid desaturase domain-containing protein  34.91 
 
 
358 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157574  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2903  fatty acid desaturase  30.36 
 
 
376 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.410754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3561  p-cymene monooxygenase, hydroxylase subunit(CymAa)  29.48 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3845  fatty acid desaturase  27.69 
 
 
367 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5477  alkane 1-monooxygenase  27.84 
 
 
329 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.354466 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  24.86 
 
 
446 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>