66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4085 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5401  Alkane 1-monooxygenase  80.1 
 
 
384 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0125234  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0853  alkane 1-monooxygenase  93.26 
 
 
386 aa  743    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.743087  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0941  alkane 1-monooxygenase  95.08 
 
 
386 aa  754    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4085  alkane 1-monooxygenase  100 
 
 
386 aa  790    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64023  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0980  alkane 1-monooxygenase  95.31 
 
 
384 aa  753    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0841  alkane 1-monooxygenase  93.52 
 
 
386 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767136  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0501  alkane-1 monooxygenase  95.31 
 
 
384 aa  753    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.070399  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1208  alkane 1-monooxygenase  80.89 
 
 
384 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000710132  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0635  alkane-1 monooxygenase  81.1 
 
 
388 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1692  alkane-1 monooxygenase  81.1 
 
 
388 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2735  alkane-1 monooxygenase  81.36 
 
 
388 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2678  alkane-1 monooxygenase  81.36 
 
 
388 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2910  alkane-1 monooxygenase  81.1 
 
 
388 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0419518  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2377  alkane-1 monooxygenase  81.1 
 
 
388 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2801  alkane-1 monooxygenase  81.36 
 
 
388 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1814  alkane-1 monooxygenase  80.84 
 
 
388 aa  628  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4221  Alkane 1-monooxygenase  75.53 
 
 
387 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4109  Alkane 1-monooxygenase  75.53 
 
 
387 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.491081  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2418  alkane 1-monooxygenase  92.63 
 
 
286 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0357839  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5739  Alkane 1-monooxygenase  55 
 
 
390 aa  448  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1742  alkane 1-monooxygenase  54 
 
 
423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.967304  normal  0.913807 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2750  Alkane 1-monooxygenase  53.22 
 
 
420 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4721  alkane 1-monooxygenase  55.36 
 
 
410 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1369  alkane 1-monooxygenase  53.42 
 
 
407 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2843  alkane 1-monooxygenase  52.76 
 
 
433 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0122  alkane 1-monooxygenase  54.29 
 
 
481 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174684  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1350  alkane 1-monooxygenase  53.38 
 
 
411 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1333  alkane 1-monooxygenase  53.38 
 
 
411 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13281  transmembrane alkane 1-monooxygenase alkB  53 
 
 
416 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.863568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3100  alkane 1-monooxygenase  53.17 
 
 
396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4212  Alkane 1-monooxygenase  50.91 
 
 
470 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0560  Alkane 1-monooxygenase  51.96 
 
 
398 aa  401  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2192  alkane 1-monooxygenase  54.96 
 
 
420 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1251  alkane 1-monooxygenase  54.45 
 
 
409 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2053  alkane 1-monooxygenase  51.91 
 
 
410 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3369  alkane 1-monooxygenase  53.87 
 
 
398 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1373  Alkane 1-monooxygenase  51.21 
 
 
403 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.935228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0443  alkane 1-monooxygenase  46.81 
 
 
401 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319502  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5439  alkane 1-monooxygenase  46.92 
 
 
403 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186555  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0610  alkane 1-monooxygenase  44.74 
 
 
406 aa  352  5.9999999999999994e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0606  alkane 1-monooxygenase  44.95 
 
 
400 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127289 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0440  alkane 1-monooxygenase  44.74 
 
 
407 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.560557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2750  alkane 1-monooxygenase  47.24 
 
 
377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.149414  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3068  hypothetical protein  40.62 
 
 
355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2925  hypothetical protein  41.51 
 
 
355 aa  276  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44700  alkane-1-monooxygenase 2  47.19 
 
 
377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0109557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3808  alkane hydroxylase  47.19 
 
 
377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2642  hypothetical protein  45.19 
 
 
382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30810  alkane-1-monooxygenase  45.03 
 
 
382 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00688507  hitchhiker  0.000000000018165 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2098  alkane 1-monooxygenase  40 
 
 
380 aa  223  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.512673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0027  alkane 1-monooxygenase  40.57 
 
 
384 aa  209  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.114958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0394  alkane 1-monooxygenase  39.06 
 
 
377 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2646  alkane 1-monooxygenase  38.56 
 
 
380 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0065  alkane 1-monooxygenase  36.83 
 
 
425 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446257  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0118  alkane 1-monooxygenase  37.68 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0516319  normal  0.119168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1467  alkane 1-monooxygenase  37.75 
 
 
423 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1262  alkane 1-monooxygenase  33.73 
 
 
400 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2541  fatty acid desaturase  40.51 
 
 
387 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00838464  hitchhiker  0.00025026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1222  alkane 1-monooxygenase  32.28 
 
 
400 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.74 
 
 
752 aa  139  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1213  alkane 1-monooxygenase  33.61 
 
 
415 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1639  fatty acid desaturase domain-containing protein  32.93 
 
 
358 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3561  p-cymene monooxygenase, hydroxylase subunit(CymAa)  27.12 
 
 
375 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2903  fatty acid desaturase  27.63 
 
 
376 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.410754 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5477  alkane 1-monooxygenase  28.79 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.354466 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3845  fatty acid desaturase  26.32 
 
 
367 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>