More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4212 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4212  Alkane 1-monooxygenase  100 
 
 		 470 aa  965    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0122  alkane 1-monooxygenase  70.15 
 
 		 481 aa  682    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5739  Alkane 1-monooxygenase  60.64 
 
 		 390 aa  485  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1369  alkane 1-monooxygenase  58.1 
 
 		 407 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1742  alkane 1-monooxygenase  55 
 
 		 423 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.967304  normal  0.913807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4721  alkane 1-monooxygenase  58.35 
 
 		 410 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1350  alkane 1-monooxygenase  57.28 
 
 		 411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1333  alkane 1-monooxygenase  57.28 
 
 		 411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3100  alkane 1-monooxygenase  55.73 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13281  transmembrane alkane 1-monooxygenase alkB  56.5 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.863568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2750  Alkane 1-monooxygenase  52.84 
 
 		 420 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0560  Alkane 1-monooxygenase  55.97 
 
 		 398 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4109  Alkane 1-monooxygenase  51.58 
 
 		 387 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.491081  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4221  Alkane 1-monooxygenase  51.58 
 
 		 387 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1373  Alkane 1-monooxygenase  57.73 
 
 		 403 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.935228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3369  alkane 1-monooxygenase  55.31 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5401  Alkane 1-monooxygenase  51.47 
 
 		 384 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0125234  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4085  alkane 1-monooxygenase  50.91 
 
 		 386 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64023  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0501  alkane-1 monooxygenase  50.26 
 
 		 384 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.070399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0980  alkane 1-monooxygenase  50.26 
 
 		 384 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0941  alkane 1-monooxygenase  49.87 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1208  alkane 1-monooxygenase  51.21 
 
 		 384 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000710132  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0853  alkane 1-monooxygenase  49.87 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.743087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2192  alkane 1-monooxygenase  51.61 
 
 		 420 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0841  alkane 1-monooxygenase  49.35 
 
 		 386 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767136  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2678  alkane-1 monooxygenase  49.59 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2801  alkane-1 monooxygenase  49.59 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2735  alkane-1 monooxygenase  49.59 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1814  alkane-1 monooxygenase  48.41 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0635  alkane-1 monooxygenase  49.59 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2377  alkane-1 monooxygenase  49.59 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2910  alkane-1 monooxygenase  49.59 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0419518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1692  alkane-1 monooxygenase  49.59 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2843  alkane 1-monooxygenase  47.3 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1251  alkane 1-monooxygenase  49.37 
 
 		 409 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0606  alkane 1-monooxygenase  45.08 
 
 		 400 aa  363  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127289 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0610  alkane 1-monooxygenase  44.06 
 
 		 406 aa  360  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0440  alkane 1-monooxygenase  44.33 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.560557  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5439  alkane 1-monooxygenase  44.1 
 
 		 403 aa  355  7.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2053  alkane 1-monooxygenase  46.52 
 
 		 410 aa  336  5e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0443  alkane 1-monooxygenase  42.71 
 
 		 401 aa  332  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2418  alkane 1-monooxygenase  54.9 
 
 		 286 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0357839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3068  hypothetical protein  44.6 
 
 		 355 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2925  hypothetical protein  44.32 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2750  alkane 1-monooxygenase  42.05 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.149414  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3808  alkane hydroxylase  40.92 
 
 		 377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44700  alkane-1-monooxygenase 2  39.89 
 
 		 377 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0109557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2642  hypothetical protein  42.04 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30810  alkane-1-monooxygenase  41.74 
 
 		 382 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00688507  hitchhiker  0.000000000018165 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2098  alkane 1-monooxygenase  38.84 
 
 		 380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.512673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0027  alkane 1-monooxygenase  37.82 
 
 		 384 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.114958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2646  alkane 1-monooxygenase  38.46 
 
 		 380 aa  205  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0065  alkane 1-monooxygenase  36.56 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446257  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0394  alkane 1-monooxygenase  35.98 
 
 		 377 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0118  alkane 1-monooxygenase  37.35 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0516319  normal  0.119168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1467  alkane 1-monooxygenase  37.05 
 
 		 423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1262  alkane 1-monooxygenase  32.45 
 
 		 400 aa  154  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2541  fatty acid desaturase  41.91 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00838464  hitchhiker  0.00025026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1222  alkane 1-monooxygenase  38.27 
 
 		 400 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.68 
 
 		 752 aa  131  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1213  alkane 1-monooxygenase  29.58 
 
 		 415 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1639  fatty acid desaturase domain-containing protein  31.02 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157574  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1743  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  72.92 
 
 		 57 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13280  rubredoxin rubA  75 
 
 		 55 aa  90.1  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.789329  normal  0.716019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4720  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.83 
 
 		 57 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1370  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  75 
 
 		 53 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2903  fatty acid desaturase  25.29 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.410754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2749  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.67 
 
 		 53 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5738  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  68.75 
 
 		 54 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1334  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.83 
 
 		 53 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1351  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.83 
 
 		 53 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359999  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3845  fatty acid desaturase  25.65 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5477  alkane 1-monooxygenase  26.25 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.354466 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0442  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.91 
 
 		 132 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.059171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5440  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 		 72 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0441  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.55 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0603  hypothetical protein  58 
 
 		 63 aa  73.6  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0608  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.27 
 
 		 172 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.128184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0439  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.27 
 
 		 172 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3561  p-cymene monooxygenase, hydroxylase subunit(CymAa)  23.53 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.72 
 
 		 62 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1377  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56 
 
 		 55 aa  63.9  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56 
 
 		 55 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.22 
 
 		 54 aa  63.2  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3672  rubredoxin  53.06 
 
 		 57 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6127  rubredoxin  54 
 
 		 55 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70630  rubredoxin 2  54 
 
 		 55 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0091  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.08 
 
 		 54 aa  60.1  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0620  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.17 
 
 		 52 aa  60.1  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.343902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.32 
 
 		 56 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60 
 
 		 54 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698268  hitchhiker  0.00824609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13279  rubredoxin rubB  58.7 
 
 		 60 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610704  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1190  putative rubredoxin protein  57.78 
 
 		 54 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.17 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1200  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.78 
 
 		 54 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196829  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.5 
 
 		 52 aa  58.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4855  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.33 
 
 		 54 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  0.0694189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6128  rubredoxin 1  54.35 
 
 		 55 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70640  rubredoxin 1  54.35 
 
 		 55 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0680  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 56 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>