66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4721 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1350  alkane 1-monooxygenase  88.92 
 
 		 411 aa  715    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1742  alkane 1-monooxygenase  90.2 
 
 		 423 aa  754    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.967304  normal  0.913807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13281  transmembrane alkane 1-monooxygenase alkB  80.15 
 
 		 416 aa  653    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.863568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4721  alkane 1-monooxygenase  100 
 
 		 410 aa  842    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1333  alkane 1-monooxygenase  88.92 
 
 		 411 aa  715    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1369  alkane 1-monooxygenase  90.84 
 
 		 407 aa  744    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2750  Alkane 1-monooxygenase  63.84 
 
 		 420 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5739  Alkane 1-monooxygenase  57.14 
 
 		 390 aa  478  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4212  Alkane 1-monooxygenase  58.35 
 
 		 470 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4221  Alkane 1-monooxygenase  55.78 
 
 		 387 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4109  Alkane 1-monooxygenase  55.78 
 
 		 387 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.491081  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5401  Alkane 1-monooxygenase  56.38 
 
 		 384 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0125234  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0122  alkane 1-monooxygenase  57.65 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174684  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1208  alkane 1-monooxygenase  56.38 
 
 		 384 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000710132  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0501  alkane-1 monooxygenase  53.79 
 
 		 384 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.070399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0941  alkane 1-monooxygenase  54.16 
 
 		 386 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0980  alkane 1-monooxygenase  53.79 
 
 		 384 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4085  alkane 1-monooxygenase  55.36 
 
 		 386 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64023  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2735  alkane-1 monooxygenase  51.51 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2678  alkane-1 monooxygenase  51.51 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1692  alkane-1 monooxygenase  51.51 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2377  alkane-1 monooxygenase  51.51 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2910  alkane-1 monooxygenase  51.51 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0419518  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0635  alkane-1 monooxygenase  51.51 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1814  alkane-1 monooxygenase  52.26 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2801  alkane-1 monooxygenase  51.51 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3100  alkane 1-monooxygenase  52.67 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0841  alkane 1-monooxygenase  51.89 
 
 		 386 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767136  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0853  alkane 1-monooxygenase  52.16 
 
 		 386 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.743087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0560  Alkane 1-monooxygenase  53.59 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2843  alkane 1-monooxygenase  51.02 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1373  Alkane 1-monooxygenase  51.28 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.935228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2192  alkane 1-monooxygenase  48.88 
 
 		 420 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1251  alkane 1-monooxygenase  52.26 
 
 		 409 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3369  alkane 1-monooxygenase  50.39 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2418  alkane 1-monooxygenase  63.37 
 
 		 286 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0357839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2053  alkane 1-monooxygenase  46.31 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0440  alkane 1-monooxygenase  44.2 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.560557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0610  alkane 1-monooxygenase  44.17 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5439  alkane 1-monooxygenase  46.21 
 
 		 403 aa  355  6.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0606  alkane 1-monooxygenase  46.46 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0443  alkane 1-monooxygenase  44.44 
 
 		 401 aa  349  6e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319502  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3068  hypothetical protein  41.53 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2925  hypothetical protein  42.81 
 
 		 355 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2750  alkane 1-monooxygenase  43.94 
 
 		 377 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.149414  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44700  alkane-1-monooxygenase 2  41.94 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0109557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3808  alkane hydroxylase  42.06 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2642  hypothetical protein  42.59 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30810  alkane-1-monooxygenase  41.42 
 
 		 382 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00688507  hitchhiker  0.000000000018165 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2098  alkane 1-monooxygenase  40.5 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.512673 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2646  alkane 1-monooxygenase  37.89 
 
 		 380 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0065  alkane 1-monooxygenase  37.85 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446257  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0027  alkane 1-monooxygenase  38.77 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.114958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0394  alkane 1-monooxygenase  37.42 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1467  alkane 1-monooxygenase  37.12 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0118  alkane 1-monooxygenase  36.5 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0516319  normal  0.119168 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1262  alkane 1-monooxygenase  39.5 
 
 		 400 aa  169  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2541  fatty acid desaturase  34.07 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00838464  hitchhiker  0.00025026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1222  alkane 1-monooxygenase  33.33 
 
 		 400 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.61 
 
 		 752 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1213  alkane 1-monooxygenase  33.75 
 
 		 415 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1639  fatty acid desaturase domain-containing protein  30.74 
 
 		 358 aa  107  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157574  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2903  fatty acid desaturase  26.35 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.410754 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3845  fatty acid desaturase  29.13 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3561  p-cymene monooxygenase, hydroxylase subunit(CymAa)  26.36 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5477  alkane 1-monooxygenase  26 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.354466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>