66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13281 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1369  alkane 1-monooxygenase  80.2 
 
 
407 aa  677    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1333  alkane 1-monooxygenase  81.44 
 
 
411 aa  674    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4721  alkane 1-monooxygenase  80.15 
 
 
410 aa  672    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13281  transmembrane alkane 1-monooxygenase alkB  100 
 
 
416 aa  852    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.863568 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1350  alkane 1-monooxygenase  81.44 
 
 
411 aa  674    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1742  alkane 1-monooxygenase  82.54 
 
 
423 aa  697    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.967304  normal  0.913807 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2750  Alkane 1-monooxygenase  64.43 
 
 
420 aa  540  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4212  Alkane 1-monooxygenase  56.5 
 
 
470 aa  451  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5739  Alkane 1-monooxygenase  54.91 
 
 
390 aa  451  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5401  Alkane 1-monooxygenase  54.66 
 
 
384 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0125234  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4109  Alkane 1-monooxygenase  52.75 
 
 
387 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.491081  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4221  Alkane 1-monooxygenase  52.75 
 
 
387 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1208  alkane 1-monooxygenase  54.82 
 
 
384 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000710132  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0980  alkane 1-monooxygenase  53.54 
 
 
384 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0941  alkane 1-monooxygenase  53.54 
 
 
386 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0501  alkane-1 monooxygenase  53.54 
 
 
384 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.070399  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3100  alkane 1-monooxygenase  53.38 
 
 
396 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4085  alkane 1-monooxygenase  53 
 
 
386 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64023  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0841  alkane 1-monooxygenase  52.02 
 
 
386 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767136  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0853  alkane 1-monooxygenase  51.77 
 
 
386 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.743087  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0122  alkane 1-monooxygenase  52.51 
 
 
481 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1814  alkane-1 monooxygenase  51.13 
 
 
388 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1692  alkane-1 monooxygenase  51 
 
 
388 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2735  alkane-1 monooxygenase  51 
 
 
388 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2678  alkane-1 monooxygenase  51 
 
 
388 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2377  alkane-1 monooxygenase  51 
 
 
388 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2910  alkane-1 monooxygenase  51 
 
 
388 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0419518  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0635  alkane-1 monooxygenase  51 
 
 
388 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2801  alkane-1 monooxygenase  51 
 
 
388 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0560  Alkane 1-monooxygenase  52.01 
 
 
398 aa  405  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2192  alkane 1-monooxygenase  51.4 
 
 
420 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1373  Alkane 1-monooxygenase  51.23 
 
 
403 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.935228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1251  alkane 1-monooxygenase  52.16 
 
 
409 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3369  alkane 1-monooxygenase  53.14 
 
 
398 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2843  alkane 1-monooxygenase  47.88 
 
 
433 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2418  alkane 1-monooxygenase  62.28 
 
 
286 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0357839  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2053  alkane 1-monooxygenase  46.48 
 
 
410 aa  361  1e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0610  alkane 1-monooxygenase  43.56 
 
 
406 aa  358  7e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0440  alkane 1-monooxygenase  43.56 
 
 
407 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.560557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0443  alkane 1-monooxygenase  44.3 
 
 
401 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319502  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5439  alkane 1-monooxygenase  43.49 
 
 
403 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186555  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0606  alkane 1-monooxygenase  45.2 
 
 
400 aa  341  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127289 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2925  hypothetical protein  42.36 
 
 
355 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3068  hypothetical protein  40.58 
 
 
355 aa  276  4e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2750  alkane 1-monooxygenase  44.28 
 
 
377 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.149414  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44700  alkane-1-monooxygenase 2  42.61 
 
 
377 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0109557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3808  alkane hydroxylase  43.58 
 
 
377 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2642  hypothetical protein  44.89 
 
 
382 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30810  alkane-1-monooxygenase  43.31 
 
 
382 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00688507  hitchhiker  0.000000000018165 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2646  alkane 1-monooxygenase  35.88 
 
 
380 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0065  alkane 1-monooxygenase  37.99 
 
 
425 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446257  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2098  alkane 1-monooxygenase  37.85 
 
 
380 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.512673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0027  alkane 1-monooxygenase  38.07 
 
 
384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.114958 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1467  alkane 1-monooxygenase  36.06 
 
 
423 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0118  alkane 1-monooxygenase  36.14 
 
 
423 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0516319  normal  0.119168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0394  alkane 1-monooxygenase  35.54 
 
 
377 aa  169  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1262  alkane 1-monooxygenase  38.93 
 
 
400 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2541  fatty acid desaturase  36.18 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00838464  hitchhiker  0.00025026 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.38 
 
 
752 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1222  alkane 1-monooxygenase  34.15 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1213  alkane 1-monooxygenase  31.3 
 
 
415 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1639  fatty acid desaturase domain-containing protein  30.95 
 
 
358 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157574  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2903  fatty acid desaturase  26.28 
 
 
376 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.410754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3561  p-cymene monooxygenase, hydroxylase subunit(CymAa)  27.68 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3845  fatty acid desaturase  26.54 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5477  alkane 1-monooxygenase  25 
 
 
329 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.354466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>