66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0853 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5401  Alkane 1-monooxygenase  78.39 
 
 		 384 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0125234  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0853  alkane 1-monooxygenase  100 
 
 		 386 aa  790    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.743087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0941  alkane 1-monooxygenase  92.75 
 
 		 386 aa  743    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4085  alkane 1-monooxygenase  93.26 
 
 		 386 aa  743    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64023  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0980  alkane 1-monooxygenase  93.47 
 
 		 384 aa  743    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0841  alkane 1-monooxygenase  96.89 
 
 		 386 aa  763    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767136  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1208  alkane 1-monooxygenase  78.91 
 
 		 384 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000710132  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0501  alkane-1 monooxygenase  93.47 
 
 		 384 aa  743    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.070399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2801  alkane-1 monooxygenase  79.22 
 
 		 388 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2735  alkane-1 monooxygenase  79.22 
 
 		 388 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1814  alkane-1 monooxygenase  78.96 
 
 		 388 aa  624  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2678  alkane-1 monooxygenase  79.22 
 
 		 388 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0635  alkane-1 monooxygenase  78.96 
 
 		 388 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1692  alkane-1 monooxygenase  78.96 
 
 		 388 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2910  alkane-1 monooxygenase  78.96 
 
 		 388 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0419518  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2377  alkane-1 monooxygenase  78.96 
 
 		 388 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4221  Alkane 1-monooxygenase  74.16 
 
 		 387 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4109  Alkane 1-monooxygenase  74.16 
 
 		 387 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.491081  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2418  alkane 1-monooxygenase  92.31 
 
 		 286 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0357839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5739  Alkane 1-monooxygenase  55.05 
 
 		 390 aa  444  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2750  Alkane 1-monooxygenase  52.97 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1742  alkane 1-monooxygenase  53.57 
 
 		 423 aa  433  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.967304  normal  0.913807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4721  alkane 1-monooxygenase  52.16 
 
 		 410 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1369  alkane 1-monooxygenase  52.94 
 
 		 407 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2843  alkane 1-monooxygenase  51.05 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1333  alkane 1-monooxygenase  52.91 
 
 		 411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1350  alkane 1-monooxygenase  52.91 
 
 		 411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0122  alkane 1-monooxygenase  53.39 
 
 		 481 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174684  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13281  transmembrane alkane 1-monooxygenase alkB  51.77 
 
 		 416 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.863568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3100  alkane 1-monooxygenase  52.65 
 
 		 396 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0560  Alkane 1-monooxygenase  51.86 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2192  alkane 1-monooxygenase  54.3 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4212  Alkane 1-monooxygenase  49.87 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2053  alkane 1-monooxygenase  52.19 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1251  alkane 1-monooxygenase  53.72 
 
 		 409 aa  381  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3369  alkane 1-monooxygenase  52.34 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1373  Alkane 1-monooxygenase  50.67 
 
 		 403 aa  363  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.935228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0443  alkane 1-monooxygenase  45.62 
 
 		 401 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0440  alkane 1-monooxygenase  44.74 
 
 		 407 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.560557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0610  alkane 1-monooxygenase  44.47 
 
 		 406 aa  349  5e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0606  alkane 1-monooxygenase  43.3 
 
 		 400 aa  346  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127289 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5439  alkane 1-monooxygenase  45.17 
 
 		 403 aa  346  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3068  hypothetical protein  42.54 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2750  alkane 1-monooxygenase  48.33 
 
 		 377 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.149414  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2925  hypothetical protein  43.12 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3808  alkane hydroxylase  48.12 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44700  alkane-1-monooxygenase 2  48.12 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0109557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2642  hypothetical protein  45.45 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30810  alkane-1-monooxygenase  44.23 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00688507  hitchhiker  0.000000000018165 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2098  alkane 1-monooxygenase  39.08 
 
 		 380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.512673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0394  alkane 1-monooxygenase  38.56 
 
 		 377 aa  205  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0027  alkane 1-monooxygenase  39.14 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.114958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2646  alkane 1-monooxygenase  38.01 
 
 		 380 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0065  alkane 1-monooxygenase  35.87 
 
 		 425 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446257  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0118  alkane 1-monooxygenase  35.65 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0516319  normal  0.119168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1467  alkane 1-monooxygenase  35.65 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1262  alkane 1-monooxygenase  39.83 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2541  fatty acid desaturase  38.17 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00838464  hitchhiker  0.00025026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1222  alkane 1-monooxygenase  31.99 
 
 		 400 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.15 
 
 		 752 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1213  alkane 1-monooxygenase  33.2 
 
 		 415 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1639  fatty acid desaturase domain-containing protein  35.21 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157574  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5477  alkane 1-monooxygenase  27.21 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.354466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3561  p-cymene monooxygenase, hydroxylase subunit(CymAa)  26.47 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2903  fatty acid desaturase  25.99 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.410754 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3845  fatty acid desaturase  28.08 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>