66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1213 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1213  alkane 1-monooxygenase  100 
 
 
415 aa  827    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0118  alkane 1-monooxygenase  37.46 
 
 
423 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0516319  normal  0.119168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1467  alkane 1-monooxygenase  36.36 
 
 
423 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0065  alkane 1-monooxygenase  35.8 
 
 
425 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446257  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2646  alkane 1-monooxygenase  33.78 
 
 
380 aa  159  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0027  alkane 1-monooxygenase  33.03 
 
 
384 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.114958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0394  alkane 1-monooxygenase  30.84 
 
 
377 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3068  hypothetical protein  27.46 
 
 
355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2925  hypothetical protein  33.09 
 
 
355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2098  alkane 1-monooxygenase  30.35 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.512673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5739  Alkane 1-monooxygenase  35.23 
 
 
390 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2418  alkane 1-monooxygenase  34.07 
 
 
286 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0357839  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4109  Alkane 1-monooxygenase  30.32 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.491081  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4221  Alkane 1-monooxygenase  30.32 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0841  alkane 1-monooxygenase  34.02 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767136  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1742  alkane 1-monooxygenase  34.17 
 
 
423 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.967304  normal  0.913807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0560  Alkane 1-monooxygenase  35.17 
 
 
398 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1814  alkane-1 monooxygenase  34.6 
 
 
388 aa  126  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2192  alkane 1-monooxygenase  34.35 
 
 
420 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1692  alkane-1 monooxygenase  35.02 
 
 
388 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2735  alkane-1 monooxygenase  35.02 
 
 
388 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2678  alkane-1 monooxygenase  35.02 
 
 
388 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2910  alkane-1 monooxygenase  35.02 
 
 
388 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0419518  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0635  alkane-1 monooxygenase  35.02 
 
 
388 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2377  alkane-1 monooxygenase  35.02 
 
 
388 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2801  alkane-1 monooxygenase  35.02 
 
 
388 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4085  alkane 1-monooxygenase  33.61 
 
 
386 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64023  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0610  alkane 1-monooxygenase  28.74 
 
 
406 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0440  alkane 1-monooxygenase  28.74 
 
 
407 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.560557  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0980  alkane 1-monooxygenase  33.61 
 
 
384 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0941  alkane 1-monooxygenase  33.61 
 
 
386 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0501  alkane-1 monooxygenase  33.61 
 
 
384 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.070399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0853  alkane 1-monooxygenase  33.2 
 
 
386 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.743087  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4721  alkane 1-monooxygenase  33.75 
 
 
410 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2843  alkane 1-monooxygenase  32.5 
 
 
433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1369  alkane 1-monooxygenase  33.33 
 
 
407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3808  alkane hydroxylase  30.43 
 
 
377 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44700  alkane-1-monooxygenase 2  30.04 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0109557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2750  alkane 1-monooxygenase  29.64 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.149414  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1333  alkane 1-monooxygenase  32.39 
 
 
411 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2053  alkane 1-monooxygenase  33.77 
 
 
410 aa  119  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1350  alkane 1-monooxygenase  32.39 
 
 
411 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5439  alkane 1-monooxygenase  29.46 
 
 
403 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186555  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2750  Alkane 1-monooxygenase  32.17 
 
 
420 aa  119  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2642  hypothetical protein  28.06 
 
 
382 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3100  alkane 1-monooxygenase  30.99 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1208  alkane 1-monooxygenase  29.91 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000710132  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30810  alkane-1-monooxygenase  27.58 
 
 
382 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00688507  hitchhiker  0.000000000018165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4212  Alkane 1-monooxygenase  29.58 
 
 
470 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5401  Alkane 1-monooxygenase  33.33 
 
 
384 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0125234  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1373  Alkane 1-monooxygenase  32.9 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.935228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0443  alkane 1-monooxygenase  28.14 
 
 
401 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319502  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0122  alkane 1-monooxygenase  32.48 
 
 
481 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174684  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1251  alkane 1-monooxygenase  33.46 
 
 
409 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3369  alkane 1-monooxygenase  31.29 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0606  alkane 1-monooxygenase  26.61 
 
 
400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13281  transmembrane alkane 1-monooxygenase alkB  31.3 
 
 
416 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.863568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2541  fatty acid desaturase  30.47 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00838464  hitchhiker  0.00025026 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.71 
 
 
752 aa  89.7  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3845  fatty acid desaturase  30.47 
 
 
367 aa  88.2  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1222  alkane 1-monooxygenase  28.71 
 
 
400 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1262  alkane 1-monooxygenase  30.13 
 
 
400 aa  87.4  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5477  alkane 1-monooxygenase  30.33 
 
 
329 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.354466 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2903  fatty acid desaturase  29.53 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.410754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3561  p-cymene monooxygenase, hydroxylase subunit(CymAa)  26.75 
 
 
375 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1639  fatty acid desaturase domain-containing protein  30.33 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>