279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2749 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2749  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
53 aa  110  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1743  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.81 
 
 
57 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884753  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1370  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.81 
 
 
53 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5738  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  72.55 
 
 
54 aa  84  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4720  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.04 
 
 
57 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13280  rubredoxin rubA  67.92 
 
 
55 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.789329  normal  0.716019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1334  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.04 
 
 
53 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1351  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.04 
 
 
53 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359999  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4212  Alkane 1-monooxygenase  66.67 
 
 
470 aa  82  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0439  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66 
 
 
172 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0608  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.128184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0442  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 
132 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.059171  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5440  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.38 
 
 
72 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366792  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0441  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1377  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.15 
 
 
55 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0122  alkane 1-monooxygenase  60.78 
 
 
481 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6127  rubredoxin  62.26 
 
 
55 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70630  rubredoxin 2  62.26 
 
 
55 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0603  hypothetical protein  59.57 
 
 
63 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6128  rubredoxin 1  56.6 
 
 
55 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70640  rubredoxin 1  56.6 
 
 
55 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0091  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.6 
 
 
54 aa  63.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94635  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1190  putative rubredoxin protein  54.72 
 
 
54 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.6 
 
 
55 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1200  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.72 
 
 
54 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196829  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2316  rubredoxin  56.6 
 
 
56 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4855  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.72 
 
 
54 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  0.0694189 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.86 
 
 
54 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698268  hitchhiker  0.00824609 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0680  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
56 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.18 
 
 
444 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  50.94 
 
 
477 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4627  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.92 
 
 
56 aa  60.1  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529245  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2626  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54 
 
 
65 aa  60.1  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
444 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1254  rubredoxin  53.85 
 
 
56 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5474  rubredoxin  52.83 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.492346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3355  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52 
 
 
57 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862516  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3191  rubredoxin  55.1 
 
 
50 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.423634  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.78 
 
 
54 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3672  rubredoxin  56 
 
 
57 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459184  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  52.5 
 
 
229 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2418  RubB protein  50.94 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
444 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2688  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.09 
 
 
54 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.243531  normal  0.0572068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5029  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
55 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.651986  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1971  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.275422 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.08 
 
 
469 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13279  rubredoxin rubB  58 
 
 
60 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610704  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  45.28 
 
 
461 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0602  rubredoxin  50.94 
 
 
58 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399652 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3592  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
55 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.1 
 
 
476 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2624  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
56 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5602  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
55 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.681813  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
55 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3173  rubredoxin  48.08 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5224  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
55 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.573132 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.08 
 
 
415 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
55 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223368 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3286  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
63 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552771  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0238  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
56 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.24657  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1999  rubredoxin  48.08 
 
 
56 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0158  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
55 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.11 
 
 
227 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3960  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
56 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3115  rubredoxin  48.08 
 
 
56 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3151  rubredoxin  48.08 
 
 
56 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0833  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
56 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0206003  hitchhiker  0.0000319456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.86 
 
 
62 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1460  rubredoxin  48.08 
 
 
56 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1135  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
57 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74035  normal  0.399177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.06 
 
 
445 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2744  rubredoxin  48.08 
 
 
56 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0668  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00929106  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
56 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  50 
 
 
589 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2330  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
56 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0569406 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0914  rubredoxin  48.08 
 
 
56 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0260  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
56 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
57 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133358  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
235 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2554  rubredoxin protein  51.92 
 
 
60 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0788  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.02 
 
 
56 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2234  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
221 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000004842  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3813  rubredoxin  48.08 
 
 
56 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131702  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02387  hypothetical protein  52.94 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3952  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.25 
 
 
61 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.336788 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0380  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1780  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.02 
 
 
63 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.322429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
55 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.552989  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0735  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0862  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0752  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.765216  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1851  rubredoxin  49.02 
 
 
63 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27651  rubredoxin  50 
 
 
53 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0866  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
56 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0534026  normal  0.223756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2526  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
56 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3687  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
59 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484857  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0611  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
60 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672431  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>