More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4424 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  100 
 
 
237 aa  494  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1537  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  84.81 
 
 
237 aa  430  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0402296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.2 
 
 
237 aa  349  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  68.35 
 
 
237 aa  346  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1649  rubrerythrin  65.82 
 
 
238 aa  323  2e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429351 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2533  rubrerythrin  65.79 
 
 
237 aa  307  8e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  64.47 
 
 
243 aa  300  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.95 
 
 
235 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0679  Rubrerythrin  42.6 
 
 
164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1376  rubrerythrin  44.58 
 
 
161 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.642256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4854  rubrerythrin  43.29 
 
 
165 aa  121  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.836415  normal  0.0724585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0090  rubrerythrin  42.41 
 
 
160 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2317  rubrerythrin/nigerythrin-like protein  45.34 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.761634 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  32.3 
 
 
165 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  33.78 
 
 
165 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  32.74 
 
 
166 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  34.84 
 
 
167 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  34.68 
 
 
165 aa  95.9  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  31.14 
 
 
181 aa  95.9  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  33.18 
 
 
166 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  34.22 
 
 
166 aa  95.9  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  31.86 
 
 
233 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  32.89 
 
 
166 aa  95.1  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  37.13 
 
 
140 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0059  rubrerythrin  37.42 
 
 
156 aa  94.7  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0465733  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  43.8 
 
 
146 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  40.85 
 
 
168 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  32.74 
 
 
166 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  33.94 
 
 
164 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  30.09 
 
 
165 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  41.36 
 
 
140 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  41.36 
 
 
140 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  40.97 
 
 
140 aa  92.8  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  35.98 
 
 
143 aa  92  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  38.65 
 
 
146 aa  92  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  30.87 
 
 
177 aa  92  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  41.36 
 
 
140 aa  91.7  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  31.33 
 
 
178 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  32.59 
 
 
166 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  41.36 
 
 
140 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  32.88 
 
 
165 aa  90.5  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  41.1 
 
 
140 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  42.03 
 
 
139 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  40.74 
 
 
140 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  40.74 
 
 
140 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  40.74 
 
 
140 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  39.02 
 
 
139 aa  89  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  30.77 
 
 
179 aa  89  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  88.6  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  88.6  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.79 
 
 
480 aa  89  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  88.6  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  88.6  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  30.94 
 
 
166 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  88.6  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  29.24 
 
 
190 aa  88.2  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  34.73 
 
 
144 aa  87.8  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  30.32 
 
 
164 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1978  rubredoxin-like  49.33 
 
 
76 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000953598  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  30.34 
 
 
179 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  39.42 
 
 
144 aa  87.4  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  41.79 
 
 
139 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  40.97 
 
 
139 aa  85.9  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  41.79 
 
 
139 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  41.79 
 
 
139 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  68 
 
 
415 aa  85.9  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  39.16 
 
 
139 aa  85.5  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  39.04 
 
 
139 aa  85.5  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  31.22 
 
 
165 aa  85.5  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  30.77 
 
 
164 aa  85.5  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0217  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.49 
 
 
58 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 
54 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  27.78 
 
 
190 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  34.87 
 
 
191 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  31 
 
 
172 aa  84.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  31.53 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0677  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.46 
 
 
53 aa  83.6  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000269222  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1081  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.46 
 
 
54 aa  84  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0767205  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.27 
 
 
53 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  32.43 
 
 
166 aa  84  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  31.08 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  29.18 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  40.88 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  39.51 
 
 
140 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.46 
 
 
53 aa  83.2  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.46 
 
 
53 aa  83.2  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1052  rubredoxin  63.83 
 
 
52 aa  82.8  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144051  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  30.63 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  30.63 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  30.63 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0147  rubredoxin  62.5 
 
 
52 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  29.85 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2699  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.22 
 
 
52 aa  82.8  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257372  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  29.6 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  32.46 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.83 
 
 
53 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  38.19 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>