More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1245 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1869  PfpI family intracellular peptidase  38.69 
 
 
171 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0031  ThiJ/PfpI  34.91 
 
 
174 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1834  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.58 
 
 
178 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0104188  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1436  PfpI family intracellular peptidase  34.91 
 
 
171 aa  98.2  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.567729  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1578  PfpI family intracellular peptidase  33.73 
 
 
171 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592224  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3309  intracellular protease  33.93 
 
 
180 aa  95.5  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0273742 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1048  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.54 
 
 
171 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0334  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.95 
 
 
183 aa  92.8  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1055  PfpI family intracellular peptidase  36.56 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0746176  normal  0.129007 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  62.26 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0730  PfpI family intracellular peptidase  33.93 
 
 
175 aa  87.4  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00450948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1622  ThiJ/PfpI  33.14 
 
 
179 aa  85.9  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.91793 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0918  hypothetical protein  32.57 
 
 
183 aa  85.1  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70 
 
 
52 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64 
 
 
52 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.403873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  40 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0257  ThiJ/PfpI domain protein  34.91 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00115501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3188  rubredoxin  70.21 
 
 
52 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0677  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.21 
 
 
53 aa  82.8  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000269222  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.96 
 
 
52 aa  80.1  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3344  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.21 
 
 
52 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000210348  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.96 
 
 
53 aa  79.7  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.96 
 
 
53 aa  79.7  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0466  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 
52 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64 
 
 
53 aa  79.3  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000285186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  29.27 
 
 
170 aa  79  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  30.51 
 
 
179 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  30.43 
 
 
194 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0203  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.21 
 
 
52 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.96 
 
 
54 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1457  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  68.09 
 
 
58 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296231  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.21 
 
 
53 aa  77.4  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27651  rubredoxin  63.83 
 
 
53 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.18 
 
 
52 aa  76.6  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2480  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  68.09 
 
 
52 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1284  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  68.09 
 
 
53 aa  75.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000469047  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0875  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 
52 aa  75.9  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000124351  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.18 
 
 
53 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2048  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.96 
 
 
52 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59994e-22 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.31 
 
 
53 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.7 
 
 
52 aa  75.1  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2175  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.83 
 
 
52 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81123  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0014  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.96 
 
 
52 aa  73.6  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.25088  normal  0.171003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0869  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.31 
 
 
52 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308024  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1052  rubredoxin  58 
 
 
52 aa  73.6  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3171  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.27 
 
 
52 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000167353  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.96 
 
 
52 aa  73.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0847  rubredoxin  60.42 
 
 
52 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2937  rubredoxin  61.22 
 
 
53 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00804477  normal  0.0175439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.17 
 
 
59 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602722 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0620  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.7 
 
 
52 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1729  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.57 
 
 
54 aa  72.4  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1443  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.36 
 
 
52 aa  72.4  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  30.72 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0101  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.45 
 
 
52 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000330254  hitchhiker  1.93244e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2501  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.22 
 
 
54 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843854  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2796  rubredoxin  61.7 
 
 
53 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.50585e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1978  rubredoxin-like  59.57 
 
 
76 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000953598  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0735  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.87 
 
 
52 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  29.89 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3222  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.96 
 
 
52 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.798538  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.7 
 
 
52 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4069  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.57 
 
 
53 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000133148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  30.86 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.57 
 
 
54 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  28.42 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2186  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.7 
 
 
52 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0152029  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  30.69 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.7 
 
 
52 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0782  rubredoxin  57.45 
 
 
53 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.45 
 
 
55 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.552989  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  28.42 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  29.38 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3194  rubredoxin  59.57 
 
 
52 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0750  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.7 
 
 
52 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000427442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  29.19 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  31.87 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.85 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  57.45 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0768  rubredoxin  55.32 
 
 
53 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3080  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.45 
 
 
54 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.3234  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.85 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0817  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3930  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.57 
 
 
53 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1135  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
57 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74035  normal  0.399177 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  31.25 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48 
 
 
480 aa  68.9  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2418  RubB protein  54.35 
 
 
55 aa  68.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1473  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.7 
 
 
52 aa  68.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  27.37 
 
 
187 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54 
 
 
56 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  31.67 
 
 
189 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  27.37 
 
 
187 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3765  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.06 
 
 
70 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0217  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.32 
 
 
58 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  26.82 
 
 
187 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09560  rubredoxin  61.7 
 
 
52 aa  68.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00690016  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2935  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58 
 
 
53 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1081  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.45 
 
 
54 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0767205  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>