More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0918 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0918  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1869  PfpI family intracellular peptidase  42.51 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0031  ThiJ/PfpI  37.87 
 
 
174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0334  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.26 
 
 
183 aa  125  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1578  PfpI family intracellular peptidase  38.18 
 
 
171 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592224  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1048  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.18 
 
 
171 aa  120  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1055  PfpI family intracellular peptidase  39.24 
 
 
201 aa  118  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0746176  normal  0.129007 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1436  PfpI family intracellular peptidase  37.28 
 
 
171 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.567729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3309  intracellular protease  34.09 
 
 
180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0273742 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1622  ThiJ/PfpI  35.26 
 
 
179 aa  94.7  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.91793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  31.58 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1834  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.98 
 
 
178 aa  88.2  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0104188  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  32.57 
 
 
186 aa  87  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  32.57 
 
 
284 aa  85.1  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  36.42 
 
 
169 aa  84.7  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3765  protease  33.33 
 
 
175 aa  84.3  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0257  ThiJ/PfpI domain protein  32.54 
 
 
174 aa  84.3  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00115501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  32.95 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  32.39 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  32.95 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  33.72 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  35.26 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  32 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  29.59 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2295  ThiJ/PfpI  33.92 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  29.76 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  30.36 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0730  PfpI family intracellular peptidase  32.35 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00450948  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  30.64 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  31.4 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  33.78 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  30.99 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  31.33 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  30 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1713  intracellular protease, PfpI family  31.55 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00460546  normal  0.198806 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  32.92 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  28.82 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  30.59 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  30.11 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  30.12 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  29.48 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  30.95 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  32.34 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  28.57 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  27.75 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  33.1 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  32.35 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1929  PfpI family intracellular peptidase  29.38 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  32.35 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  30.29 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1963  PfpI family intracellular peptidase  29.38 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710922  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  31.65 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  30.61 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  29.89 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  30.11 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.130352 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  31.76 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  31.76 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  31.76 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  31.76 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  31.76 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  31.76 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  31.76 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  28.24 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0594  intracellular protease, PfpI family  29.89 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00956999 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2407  ThiJ/PfpI  26.74 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6770  intracellular protease, PfpI family  30.11 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21709  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  31.18 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  35.71 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  26.59 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  28.16 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  28.24 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  28.65 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  27.75 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  28.9 
 
 
173 aa  67  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  30.59 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  30.59 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  30.59 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  30.59 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  28.41 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  32.3 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  30.59 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  31.74 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  28.32 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  30.13 
 
 
364 aa  65.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  32.8 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30.12 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  35 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  28.4 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  34.62 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  28.74 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  27.33 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  27.01 
 
 
241 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0371  DJ-1 family protein  31.76 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00995133  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  31.08 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  28.57 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  28.9 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0966  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  28.99 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000883438  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  27.38 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  30.26 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>