More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6345 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  100 
 
 
189 aa  391  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  66.48 
 
 
189 aa  251  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  56.45 
 
 
193 aa  238  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  58.82 
 
 
188 aa  234  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  60.77 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  58.56 
 
 
186 aa  228  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  55.38 
 
 
204 aa  224  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  55.19 
 
 
186 aa  224  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  60.12 
 
 
191 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  57.95 
 
 
186 aa  218  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  55.08 
 
 
188 aa  216  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  56.04 
 
 
197 aa  216  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  55.49 
 
 
190 aa  215  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  54.7 
 
 
185 aa  214  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  55.14 
 
 
186 aa  214  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  53.8 
 
 
187 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  53.8 
 
 
187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  56.52 
 
 
190 aa  211  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  60.57 
 
 
179 aa  211  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  52.72 
 
 
187 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  53.3 
 
 
190 aa  210  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  56.25 
 
 
181 aa  210  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  53.07 
 
 
182 aa  209  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  54.75 
 
 
192 aa  208  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  54.75 
 
 
192 aa  208  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  52.17 
 
 
187 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  55.68 
 
 
194 aa  207  7e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  53.63 
 
 
192 aa  205  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  53.3 
 
 
187 aa  202  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  54.89 
 
 
188 aa  201  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  50.54 
 
 
187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  53.93 
 
 
192 aa  198  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  51.98 
 
 
183 aa  197  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  51.96 
 
 
194 aa  197  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  49.45 
 
 
190 aa  197  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  54.34 
 
 
179 aa  195  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  52.02 
 
 
179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  50 
 
 
188 aa  194  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  51.96 
 
 
182 aa  194  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  54.02 
 
 
189 aa  193  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  50.57 
 
 
179 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  53.76 
 
 
179 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  53.07 
 
 
183 aa  190  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  51.12 
 
 
182 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  52.81 
 
 
189 aa  188  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  46.74 
 
 
186 aa  187  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  50.28 
 
 
184 aa  187  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  48.85 
 
 
180 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  49.71 
 
 
183 aa  185  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  50.87 
 
 
181 aa  185  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  47.54 
 
 
189 aa  184  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  51.11 
 
 
183 aa  184  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  49.44 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  50.28 
 
 
177 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  47.16 
 
 
180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  48.28 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  49.72 
 
 
192 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  46.59 
 
 
179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  48.57 
 
 
199 aa  181  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  52.78 
 
 
193 aa  180  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  51.46 
 
 
186 aa  180  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  46.55 
 
 
180 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  46.29 
 
 
183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  53.41 
 
 
181 aa  178  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  48.65 
 
 
189 aa  177  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  50.86 
 
 
186 aa  177  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6770  intracellular protease, PfpI family  51.45 
 
 
182 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21709  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  45.5 
 
 
189 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  50.28 
 
 
182 aa  174  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  48.09 
 
 
189 aa  174  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5584  PfpI family intracellular peptidase  50.29 
 
 
195 aa  174  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  49.43 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  49.43 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  49.43 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  48.09 
 
 
189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  48.09 
 
 
189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  48.37 
 
 
189 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  48.94 
 
 
189 aa  168  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3335  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.76 
 
 
194 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  46.55 
 
 
182 aa  168  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  45.98 
 
 
182 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  47.93 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  45.98 
 
 
182 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  45.98 
 
 
182 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  45.98 
 
 
182 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  47.09 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  42.46 
 
 
245 aa  161  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  47.7 
 
 
185 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1647  PfpI family intracellular peptidase  45.56 
 
 
186 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.920714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  41.62 
 
 
241 aa  156  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  44.83 
 
 
178 aa  154  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.85 
 
 
175 aa  153  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  47.9 
 
 
172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0922  putative protease  45.56 
 
 
187 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31560  intracellular protease, PfpI family  44.44 
 
 
184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.568268  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  43.79 
 
 
168 aa  144  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  43.43 
 
 
172 aa  143  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  41.24 
 
 
187 aa  143  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  42.44 
 
 
188 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  42.2 
 
 
188 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>