More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10413 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  62.98 
 
 		 182 aa  250  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  61.93 
 
 		 186 aa  238  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  56.45 
 
 		 189 aa  238  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  58.01 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  57.78 
 
 		 183 aa  226  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  55.91 
 
 		 204 aa  224  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  58.19 
 
 		 186 aa  218  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  56.35 
 
 		 187 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  56.35 
 
 		 187 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  56.35 
 
 		 187 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  54.14 
 
 		 186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  53.26 
 
 		 186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  55.93 
 
 		 197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  56.9 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  55.73 
 
 		 194 aa  207  7e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  53.04 
 
 		 187 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  55.49 
 
 		 190 aa  206  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  51.98 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  50.54 
 
 		 190 aa  204  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  49.73 
 
 		 189 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  53.59 
 
 		 188 aa  204  9e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  54.4 
 
 		 192 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  53.85 
 
 		 192 aa  201  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  52.75 
 
 		 192 aa  197  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  53.04 
 
 		 189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  52.49 
 
 		 188 aa  196  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  52.49 
 
 		 189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  52.25 
 
 		 192 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  52.84 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  50 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  51.16 
 
 		 181 aa  191  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  49.17 
 
 		 189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  51.46 
 
 		 179 aa  187  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  48.09 
 
 		 190 aa  186  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  51.15 
 
 		 187 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  49.1 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  50.29 
 
 		 194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  49.7 
 
 		 189 aa  181  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  52.1 
 
 		 189 aa  178  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  50.56 
 
 		 188 aa  178  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  53.18 
 
 		 183 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  50.31 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  50 
 
 		 183 aa  175  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  50.86 
 
 		 189 aa  174  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  44.51 
 
 		 188 aa  174  9e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  47.43 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  48.82 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  51.79 
 
 		 181 aa  171  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  48.63 
 
 		 189 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  46.2 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  48.09 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  43.1 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  45.6 
 
 		 189 aa  168  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  46.86 
 
 		 193 aa  168  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  50 
 
 		 172 aa  167  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  44.44 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  44.44 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  44.83 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  44.44 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  43.35 
 
 		 180 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  43.86 
 
 		 180 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  45.56 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  43.35 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  45.66 
 
 		 183 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  46.15 
 
 		 182 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  42.39 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  43.93 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  46.15 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  45.56 
 
 		 182 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  47.34 
 
 		 179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  46.15 
 
 		 182 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  48.19 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  48.19 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  48.19 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  46.15 
 
 		 182 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  48.19 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  46.15 
 
 		 182 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  48.19 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  43.68 
 
 		 182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  48.19 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  48.19 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  41.48 
 
 		 180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  46.15 
 
 		 179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5584  PfpI family intracellular peptidase  44.57 
 
 		 195 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  45.98 
 
 		 189 aa  161  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  47.59 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  48.8 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  42.61 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  48.8 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  48.8 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  48.8 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  48.8 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  44.85 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  46.99 
 
 		 172 aa  158  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  42.6 
 
 		 245 aa  157  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  42.86 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  42.29 
 
 		 182 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  43.86 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  45.78 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>