More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5376 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  100 
 
 
168 aa  345  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  57.74 
 
 
189 aa  209  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  56.55 
 
 
188 aa  206  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  54.76 
 
 
188 aa  200  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  54.76 
 
 
188 aa  200  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  50 
 
 
366 aa  167  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  47.31 
 
 
172 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  47.31 
 
 
172 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  47.31 
 
 
172 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  46.71 
 
 
172 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  46.71 
 
 
172 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  47.31 
 
 
172 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  47.31 
 
 
172 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  46.71 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  46.71 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  46.71 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  46.71 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  46.71 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  46.71 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  46.71 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  49.7 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  45.51 
 
 
172 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  45.78 
 
 
364 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  43.71 
 
 
363 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  50.92 
 
 
185 aa  157  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  45.18 
 
 
364 aa  157  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  44.05 
 
 
172 aa  157  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  45.78 
 
 
193 aa  155  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  41.67 
 
 
184 aa  154  7e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  46.71 
 
 
197 aa  153  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  45.61 
 
 
181 aa  153  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  43.45 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  46.43 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  46.11 
 
 
186 aa  151  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  44.24 
 
 
173 aa  151  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  44.97 
 
 
187 aa  150  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  49.69 
 
 
185 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  49.69 
 
 
185 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  49.69 
 
 
185 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  47.27 
 
 
184 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  47.7 
 
 
188 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  43.45 
 
 
168 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  46.47 
 
 
179 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  48.5 
 
 
189 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  47.83 
 
 
191 aa  147  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  44.58 
 
 
190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  48.5 
 
 
189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  39.76 
 
 
170 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  44.3 
 
 
177 aa  144  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  46.63 
 
 
183 aa  144  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  43.79 
 
 
189 aa  144  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  45.51 
 
 
186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  45.56 
 
 
199 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  45.88 
 
 
183 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  44.17 
 
 
181 aa  141  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  44.71 
 
 
183 aa  141  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  42.01 
 
 
187 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  47.85 
 
 
185 aa  141  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1963  PfpI family intracellular peptidase  42.26 
 
 
171 aa  140  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1929  PfpI family intracellular peptidase  42.26 
 
 
171 aa  140  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  42.94 
 
 
179 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  45.29 
 
 
189 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  45.57 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  43.53 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  46.24 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  45.03 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  44.1 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  43.86 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  44.44 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  40.88 
 
 
171 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  45.56 
 
 
186 aa  138  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  45.29 
 
 
194 aa  138  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  44.05 
 
 
194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0751  protease I, ThiJ/PfpI family protein  40.88 
 
 
171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0938  thiJ/pfpI family protein  40.88 
 
 
171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000935342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  43.27 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  40.24 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  41.76 
 
 
186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.77 
 
 
175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0802  thiJ/pfpI family protein  40.88 
 
 
171 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0842  thiJ/pfpI family protein  40.88 
 
 
171 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  44.12 
 
 
182 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  44.12 
 
 
182 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  46.01 
 
 
182 aa  137  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  42.17 
 
 
170 aa  137  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  42.26 
 
 
189 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  40.24 
 
 
187 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  42.01 
 
 
188 aa  137  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0935  thiJ/pfpI family protein  40.25 
 
 
171 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  42.69 
 
 
190 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  44.25 
 
 
189 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  42.17 
 
 
186 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6770  intracellular protease, PfpI family  48.02 
 
 
182 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0753  PfpI family intracellular peptidase  40.25 
 
 
171 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  42.94 
 
 
189 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  42.26 
 
 
182 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0746  protease I, ThiJ/PfpI family protein  40.25 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4439  intracellular protease 1  39.52 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.831334  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  44.12 
 
 
182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  42.6 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.484256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>