More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1532 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  100 
 
 
168 aa  342  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  74.4 
 
 
172 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  66.67 
 
 
184 aa  234  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  55.76 
 
 
171 aa  187  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0935  thiJ/pfpI family protein  55.76 
 
 
171 aa  185  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0753  PfpI family intracellular peptidase  55.76 
 
 
171 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0746  protease I, ThiJ/PfpI family protein  54.55 
 
 
171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0751  protease I, ThiJ/PfpI family protein  54.55 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0938  thiJ/pfpI family protein  54.55 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000935342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0802  thiJ/pfpI family protein  54.55 
 
 
171 aa  181  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4439  intracellular protease 1  54.55 
 
 
171 aa  181  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.831334  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0842  thiJ/pfpI family protein  54.55 
 
 
171 aa  181  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  54.55 
 
 
172 aa  177  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  52.98 
 
 
172 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  52.98 
 
 
172 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  52.98 
 
 
172 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  52.98 
 
 
172 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  52.98 
 
 
172 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  52.38 
 
 
172 aa  174  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  52.38 
 
 
172 aa  174  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  52.38 
 
 
172 aa  174  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  52.38 
 
 
172 aa  174  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  52.38 
 
 
172 aa  174  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  52.38 
 
 
172 aa  174  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  52.38 
 
 
172 aa  174  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  52.12 
 
 
172 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  51.79 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  47.93 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  48.75 
 
 
188 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  48.75 
 
 
188 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  47.62 
 
 
188 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  43.45 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  43.67 
 
 
168 aa  149  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1963  PfpI family intracellular peptidase  44.05 
 
 
171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1929  PfpI family intracellular peptidase  44.05 
 
 
171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  43.27 
 
 
183 aa  143  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  43.83 
 
 
193 aa  143  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  41.46 
 
 
173 aa  141  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  39.75 
 
 
168 aa  140  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  44.44 
 
 
189 aa  140  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  42.6 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  46.25 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  40 
 
 
167 aa  137  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  45.45 
 
 
184 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  38.32 
 
 
363 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  41.95 
 
 
189 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  46.88 
 
 
189 aa  133  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  42.11 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  40.7 
 
 
186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  44.51 
 
 
191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3335  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.91 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  36.53 
 
 
364 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  45.09 
 
 
189 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  41.72 
 
 
186 aa  130  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  40.61 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  41.98 
 
 
167 aa  130  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  43.79 
 
 
185 aa  130  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  45.09 
 
 
189 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  45.62 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  36.9 
 
 
366 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  41.57 
 
 
178 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  40.61 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  41.14 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  36.99 
 
 
181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  43.29 
 
 
179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  46.67 
 
 
189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  41.25 
 
 
169 aa  127  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  42.33 
 
 
187 aa  127  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  41.28 
 
 
204 aa  127  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  41.25 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  37.13 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  44.05 
 
 
189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  39.24 
 
 
364 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  44.17 
 
 
188 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  43.79 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  42.26 
 
 
186 aa  124  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  44.05 
 
 
189 aa  124  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  41.77 
 
 
173 aa  122  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  40.49 
 
 
197 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  37.95 
 
 
174 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  41.46 
 
 
179 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  36.53 
 
 
170 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  40.12 
 
 
194 aa  122  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  41.38 
 
 
181 aa  121  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  40.35 
 
 
183 aa  121  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  39.88 
 
 
187 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  40.94 
 
 
183 aa  121  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  34.73 
 
 
170 aa  121  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  41.52 
 
 
183 aa  121  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  41.52 
 
 
188 aa  120  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  38.65 
 
 
186 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  39.51 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  37.5 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  38.18 
 
 
185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  38.18 
 
 
185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1524  ThiJ/PfpI domain protein  36.97 
 
 
180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.447561  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  38.18 
 
 
185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  38.65 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  39.63 
 
 
180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  40.61 
 
 
189 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>