More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1524 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1524  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 180 aa  371  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.447561  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  56.36 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0594  intracellular protease, PfpI family  58.97 
 
 		 174 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00956999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  53.25 
 
 		 173 aa  189  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  56.17 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  52.44 
 
 		 174 aa  184  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1713  intracellular protease, PfpI family  52.12 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00460546  normal  0.198806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  43.03 
 
 		 173 aa  156  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  42.51 
 
 		 173 aa  142  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  43.9 
 
 		 168 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  43.2 
 
 		 170 aa  140  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  40.38 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  43.31 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2403  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.87 
 
 		 174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  41.1 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2580  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.59 
 
 		 174 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  38.32 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1220  ThiJ/PfpI  42.31 
 
 		 172 aa  127  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0105  ThiJ/PfpI domain protein  43.59 
 
 		 174 aa  127  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438693  normal  0.815938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  38.42 
 
 		 364 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2922  ThiJ/PfpI domain protein  40.12 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0699606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  38.18 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  37.43 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  36.97 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  41.29 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  39.74 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  40 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  38.65 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  37.95 
 
 		 364 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  40 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  40 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  40 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  40 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  38.15 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  37.79 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  37.57 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  37.57 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  39.41 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  37.18 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1052  intracellular protease, PfpI family  35.98 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.426271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  38.06 
 
 		 169 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  38.06 
 
 		 169 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  38.24 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  38.24 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  38.24 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  38.24 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  38.24 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  38.24 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  37.06 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  38.24 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  38.24 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  38.24 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  36.75 
 
 		 366 aa  108  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  36.14 
 
 		 363 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  36.31 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  38.27 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  37.87 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  35.96 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  36.69 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  35.54 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  37.04 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  34.18 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  34.12 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  33.71 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  34.12 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  35.8 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1929  PfpI family intracellular peptidase  35.44 
 
 		 171 aa  101  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  36.77 
 
 		 166 aa  100  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  39.24 
 
 		 189 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1963  PfpI family intracellular peptidase  35.44 
 
 		 171 aa  101  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  32.57 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  32.56 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  36.75 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  31.46 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  36 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  34.34 
 
 		 187 aa  98.2  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  36.53 
 
 		 186 aa  98.2  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  33.33 
 
 		 183 aa  98.2  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  33.14 
 
 		 245 aa  98.2  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  38.56 
 
 		 187 aa  97.8  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  35.88 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  34.94 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  34.36 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  35.37 
 
 		 190 aa  96.7  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  33.92 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  36.94 
 
 		 189 aa  95.5  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  36.47 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  43.86 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  31.07 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  33.95 
 
 		 194 aa  95.1  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  36.88 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  34.88 
 
 		 193 aa  94.4  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  33.75 
 
 		 185 aa  94  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  37.97 
 
 		 189 aa  94  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  41.38 
 
 		 197 aa  94  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  33.53 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  34.12 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  36.88 
 
 		 189 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  32.52 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  36.36 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>