More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2580 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2580  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  339  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0105  ThiJ/PfpI domain protein  90.17 
 
 		 174 aa  309  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438693  normal  0.815938 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2403  ThiJ/PfpI domain-containing protein  87.86 
 
 		 174 aa  302  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1220  ThiJ/PfpI  65.88 
 
 		 172 aa  220  9e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  49.7 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  47.67 
 
 		 204 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0594  intracellular protease, PfpI family  49.7 
 
 		 174 aa  154  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00956999 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1713  intracellular protease, PfpI family  47.34 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00460546  normal  0.198806 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  46.15 
 
 		 174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  40.94 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  40 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  41.42 
 
 		 172 aa  131  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1524  ThiJ/PfpI domain protein  43.59 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.447561  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  39.18 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  38.55 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  36.9 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  40.51 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  40.51 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  37.28 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2922  ThiJ/PfpI domain protein  38.65 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0699606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  38.61 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  38.32 
 
 		 364 aa  117  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  38.92 
 
 		 366 aa  115  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  34.52 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  40.11 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  37.85 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  37.27 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  38.64 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  37.95 
 
 		 363 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  37.93 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  37.5 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  38.64 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  40.59 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  38.1 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  36.65 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  37.95 
 
 		 168 aa  110  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  37.5 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  37.89 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  37.5 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  38.29 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  38.82 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  36.97 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  36.57 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  36.78 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  33.73 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  36.36 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  36 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  36.14 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  35.8 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  37.14 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  38.1 
 
 		 188 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  38.29 
 
 		 183 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  35.43 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  35.23 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  36.78 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  38.1 
 
 		 188 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  37.29 
 
 		 189 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  35.23 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  38.37 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  38.33 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  36 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  36 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.58 
 
 		 242 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  37.35 
 
 		 364 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  37.57 
 
 		 245 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  33.52 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  39.43 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  32.92 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  38.29 
 
 		 189 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  35.63 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  37.29 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  36 
 
 		 192 aa  101  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  36.93 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  36.59 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  37.29 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  36.59 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  36.59 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  36.59 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  36.59 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  38.64 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  38.29 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  37.28 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  32.95 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  37.28 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  37.28 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  38.07 
 
 		 190 aa  99  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  37.21 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  37.21 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  37.21 
 
 		 182 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  39.11 
 
 		 189 aa  97.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  32.95 
 
 		 187 aa  97.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  37.43 
 
 		 189 aa  97.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  36 
 
 		 179 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  41.52 
 
 		 191 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2828  peptidase C56, PfpI  35.54 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  36 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  36.36 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  34.48 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  37.22 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  37.43 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>