More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1190 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  100 
 
 
170 aa  351  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  50.3 
 
 
173 aa  176  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  48.21 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  47.9 
 
 
168 aa  167  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  46.43 
 
 
170 aa  164  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  46.99 
 
 
227 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1713  intracellular protease, PfpI family  43.11 
 
 
174 aa  152  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00460546  normal  0.198806 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  43.29 
 
 
204 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  44.05 
 
 
172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  42.51 
 
 
174 aa  151  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0594  intracellular protease, PfpI family  43.98 
 
 
174 aa  150  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00956999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  42.51 
 
 
188 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  42.17 
 
 
173 aa  149  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  42.86 
 
 
364 aa  148  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  45.03 
 
 
172 aa  147  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  42.17 
 
 
188 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  42.17 
 
 
188 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  44.44 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  44.44 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  44.44 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  44.44 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  44.44 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  44.44 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  44.44 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  44.44 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  43.27 
 
 
172 aa  145  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  43.27 
 
 
172 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  43.27 
 
 
172 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  43.27 
 
 
172 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  43.27 
 
 
172 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  39.76 
 
 
168 aa  145  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  43.27 
 
 
172 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2922  ThiJ/PfpI domain protein  44.24 
 
 
167 aa  142  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0699606  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  39.88 
 
 
366 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  40 
 
 
189 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1524  ThiJ/PfpI domain protein  43.2 
 
 
180 aa  140  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.447561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  40.96 
 
 
363 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  39.05 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  38.92 
 
 
364 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  38.92 
 
 
197 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  37.21 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  36.05 
 
 
181 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  37.5 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  39.62 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  38.95 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  38.73 
 
 
186 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1052  intracellular protease, PfpI family  38.92 
 
 
167 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.426271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  39.63 
 
 
169 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  36.84 
 
 
189 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  39.02 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  35.88 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  38.32 
 
 
186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  38.46 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  36.63 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  40.35 
 
 
189 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  35.67 
 
 
186 aa  124  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1220  ThiJ/PfpI  36.9 
 
 
172 aa  124  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  36.63 
 
 
185 aa  124  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  36.9 
 
 
185 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  38.32 
 
 
187 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  36.9 
 
 
185 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  36.26 
 
 
181 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  36.9 
 
 
185 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0935  thiJ/pfpI family protein  35.67 
 
 
171 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  36.99 
 
 
186 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  36.69 
 
 
193 aa  122  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  38.65 
 
 
167 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  36.26 
 
 
171 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  37.79 
 
 
190 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  36.53 
 
 
168 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  36.84 
 
 
191 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0746  protease I, ThiJ/PfpI family protein  36.26 
 
 
171 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2580  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.9 
 
 
174 aa  122  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  38.37 
 
 
179 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  37.13 
 
 
188 aa  121  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  40.85 
 
 
187 aa  121  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  37.72 
 
 
187 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  37.13 
 
 
178 aa  121  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  37.28 
 
 
183 aa  121  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  40.35 
 
 
189 aa  120  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  37.42 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0802  thiJ/pfpI family protein  35.29 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0751  protease I, ThiJ/PfpI family protein  35.29 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0842  thiJ/pfpI family protein  35.29 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  37.13 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0938  thiJ/pfpI family protein  35.29 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000935342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4439  intracellular protease 1  35.67 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.831334  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0753  PfpI family intracellular peptidase  35.67 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  35.5 
 
 
182 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  35.5 
 
 
182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  36.69 
 
 
182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  38.69 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  36.26 
 
 
179 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  34.12 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  37.65 
 
 
199 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2403  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.31 
 
 
174 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  35.93 
 
 
189 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  37.74 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  37.95 
 
 
187 aa  117  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  36.81 
 
 
169 aa  117  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>