More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2409 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  100 
 
 		 167 aa  340  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  82.63 
 
 		 167 aa  287  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  72.89 
 
 		 167 aa  257  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  65.87 
 
 		 169 aa  227  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  65.27 
 
 		 169 aa  226  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  54.82 
 
 		 166 aa  204  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  48.19 
 
 		 166 aa  174  7e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  50 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  45.18 
 
 		 169 aa  158  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  46.11 
 
 		 182 aa  154  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  40 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  42.94 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  46.15 
 
 		 191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2318  ThiJ/PfpI domain protein  38.79 
 
 		 232 aa  140  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  41.9 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  44.25 
 
 		 192 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  43.68 
 
 		 192 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  43.71 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  39.76 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  44.58 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  41.32 
 
 		 189 aa  135  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  43.2 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  40.72 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  44.05 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  44.17 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  43.1 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  40.74 
 
 		 172 aa  134  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  43.21 
 
 		 173 aa  134  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  44.38 
 
 		 182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  44.38 
 
 		 182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  40.48 
 
 		 168 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0594  intracellular protease, PfpI family  42.59 
 
 		 174 aa  134  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00956999 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  39.39 
 
 		 168 aa  134  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  39.76 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  40 
 
 		 186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  43.79 
 
 		 182 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  41.18 
 
 		 187 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  40.61 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  41.82 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  42.6 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  39.64 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  41.07 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  40.48 
 
 		 245 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  41.32 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  43.2 
 
 		 182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  43.2 
 
 		 182 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0753  PfpI family intracellular peptidase  41.32 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  40 
 
 		 187 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  41.38 
 
 		 190 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  40.72 
 
 		 187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  42.17 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  42.17 
 
 		 179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  39.41 
 
 		 189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  40.8 
 
 		 190 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  40.83 
 
 		 183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  41.07 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  41.76 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  40.83 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0935  thiJ/pfpI family protein  40.72 
 
 		 171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0751  protease I, ThiJ/PfpI family protein  40.48 
 
 		 171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0938  thiJ/pfpI family protein  40.48 
 
 		 171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000935342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  40.48 
 
 		 179 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  41.07 
 
 		 180 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4439  intracellular protease 1  40.12 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.831334  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  38.82 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  40.13 
 
 		 168 aa  124  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  38.51 
 
 		 192 aa  123  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  41.32 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  41.32 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  41.32 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2231  intracellular protease, PfpI family  41.67 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  40.12 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0802  thiJ/pfpI family protein  39.88 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  40.12 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0842  thiJ/pfpI family protein  39.88 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  41.32 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  42.6 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  40.12 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  41.32 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  41.32 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  42.77 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  40.12 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  41.32 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  40.12 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0746  protease I, ThiJ/PfpI family protein  39.52 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  36.42 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  42.77 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  38.24 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  39.64 
 
 		 183 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  41.25 
 
 		 183 aa  120  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2828  peptidase C56, PfpI  38.37 
 
 		 179 aa  120  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  41.92 
 
 		 185 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  37.28 
 
 		 188 aa  120  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  38.18 
 
 		 241 aa  120  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  40.12 
 
 		 172 aa  120  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  37.65 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1713  intracellular protease, PfpI family  38.71 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00460546  normal  0.198806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2501  intracellular protease, PfpI family  38.55 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.248652  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  37.65 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  39.16 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>