More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3024 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  100 
 
 		 166 aa  342  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  58.43 
 
 		 167 aa  209  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  54.82 
 
 		 167 aa  204  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  55.42 
 
 		 169 aa  197  3.9999999999999996e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  53.01 
 
 		 167 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  50 
 
 		 169 aa  184  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  49.4 
 
 		 169 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  51.2 
 
 		 173 aa  174  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  45.78 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  47.24 
 
 		 204 aa  147  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  46.99 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0594  intracellular protease, PfpI family  47.56 
 
 		 174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00956999 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  43.1 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  42.53 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  46.3 
 
 		 173 aa  141  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  44.24 
 
 		 187 aa  140  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  40.83 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  43.29 
 
 		 245 aa  139  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  39.53 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  41.67 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  41.76 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  41.67 
 
 		 188 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  41.95 
 
 		 192 aa  137  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  41.32 
 
 		 182 aa  137  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  42.6 
 
 		 189 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  40.48 
 
 		 188 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  40 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1713  intracellular protease, PfpI family  42.94 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00460546  normal  0.198806 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  37.95 
 
 		 172 aa  134  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  42.68 
 
 		 168 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  38.82 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  43.04 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  43.95 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  39.05 
 
 		 186 aa  130  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  40.59 
 
 		 186 aa  130  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  42.01 
 
 		 183 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  38.24 
 
 		 193 aa  130  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  39.26 
 
 		 241 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2231  intracellular protease, PfpI family  40 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  40 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  36.97 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  36.84 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  39.62 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  38.24 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  40.61 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  35.75 
 
 		 187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  38.32 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  37.93 
 
 		 192 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2501  intracellular protease, PfpI family  38.55 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.248652  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  40.61 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2318  ThiJ/PfpI domain protein  36.36 
 
 		 232 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  38.99 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  41.42 
 
 		 183 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  39.77 
 
 		 190 aa  124  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  36.47 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  37.13 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  38.82 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2828  peptidase C56, PfpI  35.47 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1373  intracellular protease, PfpI family  38.89 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228619  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  37.5 
 
 		 181 aa  121  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  36.53 
 
 		 189 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  40.12 
 
 		 172 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  40.12 
 
 		 172 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  40.12 
 
 		 172 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  36.02 
 
 		 186 aa  121  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  40.12 
 
 		 172 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  40.12 
 
 		 172 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  38.75 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  36.53 
 
 		 183 aa  120  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1052  intracellular protease, PfpI family  38.79 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.426271  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  35.88 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  39.88 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  41.07 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  35.93 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  39.05 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  39.05 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  37.11 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  38.12 
 
 		 204 aa  118  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  35.88 
 
 		 186 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  36.02 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0105  ThiJ/PfpI domain protein  37.97 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438693  normal  0.815938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  37.95 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2580  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.61 
 
 		 174 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  38.51 
 
 		 190 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1524  ThiJ/PfpI domain protein  41.29 
 
 		 180 aa  117  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.447561  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  39.02 
 
 		 184 aa  117  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  38.92 
 
 		 172 aa  117  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  35.76 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  36.31 
 
 		 189 aa  117  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  36.14 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  38.92 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  38.92 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  38.92 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  38.92 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  38.32 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  38.92 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  37.65 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  38.46 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  38.92 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  38.46 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>