More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4051 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  100 
 
 		 169 aa  343  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  97.63 
 
 		 169 aa  339  8e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  68.67 
 
 		 167 aa  237  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  65.87 
 
 		 167 aa  227  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  61.08 
 
 		 167 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  49.4 
 
 		 166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  44.58 
 
 		 166 aa  160  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  49.1 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  44.83 
 
 		 192 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  44.83 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  43.71 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  44.25 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  46.06 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  41.57 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  43.2 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  43.2 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  43.2 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  43.2 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  43.2 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  43.2 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  43.2 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  43.2 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  43.2 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  46.71 
 
 		 182 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  43.2 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  46.71 
 
 		 182 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  44.97 
 
 		 183 aa  141  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  41.92 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  41.92 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0751  protease I, ThiJ/PfpI family protein  41.67 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  42.08 
 
 		 191 aa  138  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0938  thiJ/pfpI family protein  41.67 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000935342 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  46.39 
 
 		 183 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  41.42 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  41.42 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  41.42 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  41.42 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  41.42 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  46.99 
 
 		 182 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  46.99 
 
 		 182 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0802  thiJ/pfpI family protein  41.07 
 
 		 171 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0842  thiJ/pfpI family protein  41.07 
 
 		 171 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  44.79 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4439  intracellular protease 1  41.32 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.831334  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  42.51 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  46.39 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0753  PfpI family intracellular peptidase  41.32 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2318  ThiJ/PfpI domain protein  39.52 
 
 		 232 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  43.53 
 
 		 186 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  42.01 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  46.01 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0746  protease I, ThiJ/PfpI family protein  40.72 
 
 		 171 aa  134  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  43.71 
 
 		 174 aa  134  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  43.86 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  43.98 
 
 		 183 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  42.77 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  40.72 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  41.46 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0935  thiJ/pfpI family protein  40.12 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  42.58 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  35.76 
 
 		 170 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  44.58 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  40.12 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  41.72 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  39.51 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  44.44 
 
 		 173 aa  131  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  37.91 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  36.65 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  41.76 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  39.02 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  41.07 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  39.76 
 
 		 189 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  39.41 
 
 		 187 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  39.88 
 
 		 172 aa  127  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  44.64 
 
 		 185 aa  127  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  39.39 
 
 		 190 aa  127  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  39.63 
 
 		 180 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  39.63 
 
 		 170 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  42.14 
 
 		 245 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  40 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  39.63 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  38.51 
 
 		 192 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  42.41 
 
 		 241 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  42.59 
 
 		 204 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  41.25 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  39.88 
 
 		 190 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  41.61 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  40.99 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  40.96 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  38.24 
 
 		 197 aa  124  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  38.41 
 
 		 180 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  38.82 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3754  intracellular protease, PfpI family  40.54 
 
 		 201 aa  124  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  38.24 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  42.33 
 
 		 189 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  39.88 
 
 		 179 aa  124  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  38.24 
 
 		 189 aa  124  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  38.55 
 
 		 177 aa  124  7e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  40.8 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  40.46 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>