More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3345 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  100 
 
 
172 aa  347  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  100 
 
 
172 aa  347  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  100 
 
 
172 aa  347  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  100 
 
 
172 aa  347  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  100 
 
 
172 aa  347  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  100 
 
 
172 aa  347  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  347  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  99.42 
 
 
172 aa  346  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  98.84 
 
 
172 aa  344  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  94.77 
 
 
172 aa  329  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  94.77 
 
 
172 aa  329  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  94.77 
 
 
172 aa  329  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  94.77 
 
 
172 aa  329  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  94.77 
 
 
172 aa  329  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  89.53 
 
 
172 aa  316  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0935  thiJ/pfpI family protein  60.23 
 
 
171 aa  223  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  60.23 
 
 
171 aa  222  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0746  protease I, ThiJ/PfpI family protein  59.65 
 
 
171 aa  220  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0751  protease I, ThiJ/PfpI family protein  60 
 
 
171 aa  220  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0753  PfpI family intracellular peptidase  59.65 
 
 
171 aa  220  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0938  thiJ/pfpI family protein  60 
 
 
171 aa  220  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000935342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0802  thiJ/pfpI family protein  59.41 
 
 
171 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0842  thiJ/pfpI family protein  59.41 
 
 
171 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4439  intracellular protease 1  59.06 
 
 
171 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.831334  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  54.49 
 
 
184 aa  187  8e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  54.39 
 
 
172 aa  187  8e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  52.38 
 
 
168 aa  174  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  46.71 
 
 
168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1963  PfpI family intracellular peptidase  49.42 
 
 
171 aa  164  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1929  PfpI family intracellular peptidase  49.42 
 
 
171 aa  164  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  48.19 
 
 
193 aa  161  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  48.85 
 
 
172 aa  159  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  50.3 
 
 
187 aa  158  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  46.11 
 
 
189 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  45.83 
 
 
188 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  45.83 
 
 
188 aa  154  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  47.06 
 
 
168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  44.64 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  44.83 
 
 
186 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  45.88 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  47.85 
 
 
197 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  44.44 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  45.4 
 
 
187 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  43.79 
 
 
169 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  43.2 
 
 
169 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  44.19 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  45.06 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  40.83 
 
 
364 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  44.91 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  41.36 
 
 
173 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  41.62 
 
 
183 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  40.24 
 
 
366 aa  136  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  45.24 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  39.88 
 
 
364 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  41.32 
 
 
167 aa  134  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  41.04 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  44.58 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  47.31 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  44.05 
 
 
204 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  46.71 
 
 
189 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  44.85 
 
 
191 aa  131  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  41.67 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  45.61 
 
 
188 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  44.85 
 
 
185 aa  131  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  44.85 
 
 
185 aa  131  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  44.85 
 
 
185 aa  131  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  42.6 
 
 
188 aa  130  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  43.6 
 
 
189 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  42.11 
 
 
174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  39.77 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  41.42 
 
 
173 aa  129  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  45.51 
 
 
189 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  45.18 
 
 
190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  38.29 
 
 
181 aa  127  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  42.42 
 
 
186 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  42.68 
 
 
190 aa  127  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  44.31 
 
 
189 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  44.58 
 
 
192 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  42.07 
 
 
186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  43.2 
 
 
184 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  40 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  39.53 
 
 
186 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  43.03 
 
 
189 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3335  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.11 
 
 
194 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6770  intracellular protease, PfpI family  42.22 
 
 
182 aa  124  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21709  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  43.03 
 
 
189 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  41.32 
 
 
167 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  43.02 
 
 
181 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  39.66 
 
 
179 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  42.51 
 
 
190 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  42.17 
 
 
192 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  42.17 
 
 
192 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  42.77 
 
 
192 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  43.29 
 
 
186 aa  121  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  42.77 
 
 
189 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  40.46 
 
 
182 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  38.79 
 
 
178 aa  121  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  37.11 
 
 
363 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  40.62 
 
 
168 aa  120  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  45.06 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>