More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2558 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  100 
 
 		 172 aa  351  2.9999999999999997e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  74.4 
 
 		 168 aa  265  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  65.48 
 
 		 184 aa  227  6e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  56.14 
 
 		 172 aa  193  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0935  thiJ/pfpI family protein  54.97 
 
 		 171 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0746  protease I, ThiJ/PfpI family protein  54.39 
 
 		 171 aa  191  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  53.8 
 
 		 171 aa  191  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0802  thiJ/pfpI family protein  55.29 
 
 		 171 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0842  thiJ/pfpI family protein  55.29 
 
 		 171 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0751  protease I, ThiJ/PfpI family protein  54.71 
 
 		 171 aa  190  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0938  thiJ/pfpI family protein  54.71 
 
 		 171 aa  190  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000935342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  55.56 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  55.56 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  55.56 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  55.56 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  55.56 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0753  PfpI family intracellular peptidase  53.8 
 
 		 171 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  54.39 
 
 		 172 aa  187  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  54.39 
 
 		 172 aa  187  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  54.39 
 
 		 172 aa  187  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  54.39 
 
 		 172 aa  187  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  54.39 
 
 		 172 aa  187  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  54.39 
 
 		 172 aa  187  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  54.39 
 
 		 172 aa  187  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4439  intracellular protease 1  53.22 
 
 		 171 aa  186  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.831334  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  53.8 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  53.8 
 
 		 172 aa  185  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  47.37 
 
 		 188 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  49.38 
 
 		 188 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  46.78 
 
 		 188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  46.47 
 
 		 189 aa  163  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1929  PfpI family intracellular peptidase  45.29 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1963  PfpI family intracellular peptidase  45.29 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  44.05 
 
 		 168 aa  157  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  47.67 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  46.34 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  42.5 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  45.12 
 
 		 183 aa  151  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  44.12 
 
 		 172 aa  151  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  43.48 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  47.9 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  44.51 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  48.47 
 
 		 183 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  49.07 
 
 		 189 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3335  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.46 
 
 		 194 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  44.38 
 
 		 191 aa  144  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  42.11 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  45.06 
 
 		 197 aa  141  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  43.86 
 
 		 204 aa  141  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  42.11 
 
 		 185 aa  141  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  38.82 
 
 		 364 aa  141  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  42.11 
 
 		 186 aa  140  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  44.71 
 
 		 186 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  41.36 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  45.34 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  44.44 
 
 		 194 aa  139  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  44.19 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  42.51 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  40.7 
 
 		 182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  41.32 
 
 		 364 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  40.7 
 
 		 182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  40.35 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  46.63 
 
 		 190 aa  137  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  46.3 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  40 
 
 		 366 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  42.68 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  42.68 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  42.68 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  40.74 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  37.13 
 
 		 363 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  45.68 
 
 		 189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  41.36 
 
 		 167 aa  134  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  38.55 
 
 		 174 aa  134  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  42.11 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  43.04 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  40.49 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  44.72 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  39.51 
 
 		 169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  42.44 
 
 		 188 aa  131  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  41.04 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  40.99 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  41.04 
 
 		 189 aa  130  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  39.75 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  38.89 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  37.42 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  46.41 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  42.33 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  38.95 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  39.64 
 
 		 180 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  39.53 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  40.74 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1524  ThiJ/PfpI domain protein  38.32 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.447561  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  36.69 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  37.04 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  43.21 
 
 		 189 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  45 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  41.4 
 
 		 173 aa  127  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  39.53 
 
 		 183 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  40.85 
 
 		 178 aa  127  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  45.16 
 
 		 189 aa  127  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>