More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1035 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  100 
 
 
182 aa  363  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  83.52 
 
 
185 aa  305  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  76.37 
 
 
185 aa  281  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  76.37 
 
 
185 aa  281  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  76.37 
 
 
185 aa  281  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  63.07 
 
 
181 aa  222  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  57.8 
 
 
197 aa  206  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  58.05 
 
 
186 aa  200  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  57.14 
 
 
190 aa  197  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  60.82 
 
 
187 aa  197  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  55.06 
 
 
188 aa  197  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  56.5 
 
 
190 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  56.25 
 
 
189 aa  193  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  56.57 
 
 
189 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  53.37 
 
 
184 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  56.57 
 
 
189 aa  188  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  57.89 
 
 
183 aa  184  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  52.3 
 
 
194 aa  184  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  54.64 
 
 
188 aa  184  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  50.86 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  48.9 
 
 
189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  51.43 
 
 
189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  50.29 
 
 
185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  48.02 
 
 
183 aa  181  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  50.29 
 
 
189 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  56.5 
 
 
192 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  49.18 
 
 
191 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  56.14 
 
 
189 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  47.67 
 
 
179 aa  174  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  50.28 
 
 
189 aa  174  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  51.7 
 
 
189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  48.02 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  47.98 
 
 
180 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  47.4 
 
 
179 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  48.55 
 
 
180 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  46.33 
 
 
186 aa  168  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  51.91 
 
 
189 aa  168  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  48.85 
 
 
181 aa  167  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  52.27 
 
 
181 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  47.9 
 
 
187 aa  166  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  47.73 
 
 
177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6770  intracellular protease, PfpI family  51.7 
 
 
182 aa  164  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21709  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  47.09 
 
 
179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  46.82 
 
 
180 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.88 
 
 
175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  47.7 
 
 
188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  47.95 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  48.26 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  49.41 
 
 
199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  48.62 
 
 
189 aa  160  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  51.72 
 
 
245 aa  160  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  46.51 
 
 
179 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  47.9 
 
 
179 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  50 
 
 
178 aa  157  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17170  intracellular protease, PfpI family  50 
 
 
197 aa  157  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816249  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  46.55 
 
 
183 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  42.29 
 
 
193 aa  156  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  48.24 
 
 
182 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  48.24 
 
 
182 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  48.24 
 
 
182 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  46.59 
 
 
183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  45.98 
 
 
183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  45.4 
 
 
183 aa  154  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  45.14 
 
 
187 aa  153  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0228  intracellular protease, PfpI family  49.71 
 
 
185 aa  153  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  44.07 
 
 
189 aa  153  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  47.06 
 
 
182 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  46.78 
 
 
182 aa  153  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  48.28 
 
 
241 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  45.03 
 
 
186 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5584  PfpI family intracellular peptidase  52.33 
 
 
195 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  52.91 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  46.47 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  46.82 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  50.3 
 
 
194 aa  150  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  46.43 
 
 
182 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31560  intracellular protease, PfpI family  48.59 
 
 
184 aa  149  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.568268  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  45.83 
 
 
182 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  43.6 
 
 
186 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  48.81 
 
 
186 aa  148  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  44.77 
 
 
204 aa  147  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  47.95 
 
 
192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  43.18 
 
 
187 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  42.13 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  43.18 
 
 
187 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  42.29 
 
 
187 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0077  peptidase C56, PfpI  44.05 
 
 
174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0445898  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  44.75 
 
 
186 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1647  PfpI family intracellular peptidase  46.33 
 
 
186 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.920714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  42.61 
 
 
187 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  47.37 
 
 
192 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  46.2 
 
 
192 aa  140  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  43.53 
 
 
179 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  45.09 
 
 
192 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  45.61 
 
 
190 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  44.24 
 
 
184 aa  137  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  46.01 
 
 
168 aa  137  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  46.39 
 
 
188 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  45.88 
 
 
189 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  46.99 
 
 
188 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>