More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4290 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  100 
 
 
182 aa  371  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  62.98 
 
 
193 aa  250  9.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  59.32 
 
 
186 aa  236  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  58.29 
 
 
183 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  53.89 
 
 
187 aa  211  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  55.31 
 
 
189 aa  210  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  54.29 
 
 
186 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  55.87 
 
 
204 aa  209  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  53.07 
 
 
189 aa  209  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  53.37 
 
 
186 aa  205  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  55.11 
 
 
197 aa  202  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  52.81 
 
 
187 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  53.37 
 
 
186 aa  201  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  53.98 
 
 
186 aa  201  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  52.25 
 
 
187 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  52.81 
 
 
188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  54.95 
 
 
192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  51.69 
 
 
187 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  52.75 
 
 
192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  52.46 
 
 
192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  54.86 
 
 
177 aa  194  8.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  49.44 
 
 
187 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  52.87 
 
 
190 aa  192  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  47.98 
 
 
181 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  53.07 
 
 
190 aa  191  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  53.01 
 
 
185 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  53.76 
 
 
187 aa  188  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  50 
 
 
188 aa  188  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  52.51 
 
 
194 aa  186  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  50 
 
 
192 aa  184  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  48.89 
 
 
188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  48.85 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  52.73 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  51.76 
 
 
181 aa  181  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  54.97 
 
 
183 aa  179  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  47.8 
 
 
190 aa  178  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  50.56 
 
 
189 aa  178  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  47.25 
 
 
190 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  50.56 
 
 
189 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  49.72 
 
 
188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  48.07 
 
 
189 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  49.7 
 
 
189 aa  168  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  48.62 
 
 
189 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  46.67 
 
 
189 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  48.62 
 
 
189 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  44.83 
 
 
194 aa  164  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  47.65 
 
 
184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  50 
 
 
186 aa  164  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  47.06 
 
 
185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  47.06 
 
 
185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  47.06 
 
 
185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  46.75 
 
 
182 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  46.75 
 
 
182 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  47.67 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  44.12 
 
 
179 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  46.75 
 
 
183 aa  159  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  46.15 
 
 
182 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  44.44 
 
 
189 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  43.1 
 
 
182 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  42.77 
 
 
199 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  44.64 
 
 
183 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  45.24 
 
 
182 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  45.24 
 
 
182 aa  158  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  43.35 
 
 
182 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  43.5 
 
 
189 aa  157  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  44.64 
 
 
245 aa  157  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  47.31 
 
 
167 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  45.29 
 
 
189 aa  156  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  46.82 
 
 
181 aa  156  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6770  intracellular protease, PfpI family  47.7 
 
 
182 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21709  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  42.94 
 
 
179 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  42.35 
 
 
183 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  42.94 
 
 
180 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  46.11 
 
 
167 aa  154  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  42.94 
 
 
186 aa  154  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  41.76 
 
 
179 aa  154  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  46.78 
 
 
182 aa  153  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5584  PfpI family intracellular peptidase  44 
 
 
195 aa  153  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  43.75 
 
 
192 aa  153  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  40.7 
 
 
180 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  43.98 
 
 
189 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  42.35 
 
 
183 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  44.05 
 
 
179 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  40.12 
 
 
179 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  42.22 
 
 
193 aa  150  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  43.02 
 
 
241 aa  150  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  44.38 
 
 
185 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  42.86 
 
 
179 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  40.59 
 
 
180 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  45.88 
 
 
172 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  45.88 
 
 
172 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  45.03 
 
 
168 aa  147  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  45.88 
 
 
172 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  45.88 
 
 
172 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  45.88 
 
 
172 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  45.88 
 
 
172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  45.88 
 
 
172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  45.88 
 
 
172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  45.88 
 
 
172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  45.88 
 
 
172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>