More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1491 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  93.58 
 
 		 187 aa  357  6e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  91.98 
 
 		 187 aa  352  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  81.82 
 
 		 187 aa  318  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  72.13 
 
 		 186 aa  276  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  68.31 
 
 		 186 aa  268  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  64.13 
 
 		 186 aa  256  9e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  60.66 
 
 		 190 aa  235  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  60.66 
 
 		 190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  58.56 
 
 		 192 aa  228  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  58.56 
 
 		 192 aa  228  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  58.56 
 
 		 192 aa  227  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  58.01 
 
 		 192 aa  222  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  54.55 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  56.35 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  53.8 
 
 		 186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  53.85 
 
 		 183 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  53.26 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  52.17 
 
 		 189 aa  207  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  52.15 
 
 		 197 aa  206  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  53.63 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  55 
 
 		 181 aa  200  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  51.69 
 
 		 182 aa  199  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  50.27 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  47.57 
 
 		 189 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  46.24 
 
 		 188 aa  187  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  48.35 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  48.9 
 
 		 191 aa  185  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  46.45 
 
 		 188 aa  184  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  52 
 
 		 183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  50.85 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  49.71 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  45.86 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  45.74 
 
 		 190 aa  178  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  48.59 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  47.46 
 
 		 179 aa  177  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  45 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  42.78 
 
 		 190 aa  174  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  46.63 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  46.86 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  46.89 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  46.89 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  45.05 
 
 		 189 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  46.89 
 
 		 182 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  46.89 
 
 		 182 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  46.89 
 
 		 182 aa  167  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  46.89 
 
 		 182 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  46.89 
 
 		 182 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  45.76 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  46.52 
 
 		 189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  44.25 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  44.57 
 
 		 189 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  43.24 
 
 		 189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  45.76 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  45.99 
 
 		 189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  48 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  44.13 
 
 		 177 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  43.78 
 
 		 189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  44.07 
 
 		 180 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  45.21 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  44.81 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  43.82 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31560  intracellular protease, PfpI family  45.11 
 
 		 184 aa  158  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.568268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09940  putative protease  46.24 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  43.58 
 
 		 182 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  44.39 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0922  putative protease  46.2 
 
 		 187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  41.44 
 
 		 199 aa  154  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  44.94 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  41.9 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  41.9 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  41.9 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  46.33 
 
 		 188 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  43.5 
 
 		 183 aa  151  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  42.86 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  45.76 
 
 		 188 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  43.09 
 
 		 183 aa  150  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  45.76 
 
 		 188 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  42.2 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  43.32 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  42.46 
 
 		 241 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17170  intracellular protease, PfpI family  42.53 
 
 		 197 aa  148  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0228  intracellular protease, PfpI family  41.71 
 
 		 185 aa  148  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  41.57 
 
 		 182 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  41.76 
 
 		 183 aa  147  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  39.88 
 
 		 184 aa  147  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  41.48 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  44.44 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  43.18 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  44 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1647  PfpI family intracellular peptidase  44.09 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.920714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  41.67 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  43.43 
 
 		 179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  40.78 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  41.81 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  42.11 
 
 		 168 aa  140  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  43.27 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0077  peptidase C56, PfpI  42.26 
 
 		 174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0445898  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  40.24 
 
 		 168 aa  138  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  41.11 
 
 		 188 aa  138  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.932394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>