More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_09940 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_09940  putative protease  100 
 
 
187 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253725  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0922  putative protease  89.84 
 
 
187 aa  345  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1647  PfpI family intracellular peptidase  73.12 
 
 
186 aa  289  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.920714 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31560  intracellular protease, PfpI family  48.37 
 
 
184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.568268  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0228  intracellular protease, PfpI family  46.49 
 
 
185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17170  intracellular protease, PfpI family  46.52 
 
 
197 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816249  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  46.24 
 
 
187 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  45.11 
 
 
187 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  44.92 
 
 
192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  45.65 
 
 
197 aa  154  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  46.24 
 
 
187 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6770  intracellular protease, PfpI family  43.75 
 
 
182 aa  154  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21709  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  44.62 
 
 
187 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0410  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  45 
 
 
182 aa  151  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.532104  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  46.93 
 
 
189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  46.11 
 
 
186 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  46.37 
 
 
189 aa  149  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  43.78 
 
 
179 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  43.75 
 
 
189 aa  148  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  47.37 
 
 
184 aa  147  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  45.98 
 
 
186 aa  147  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  43.98 
 
 
183 aa  147  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  44.69 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  44.69 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  44.69 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  43.02 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  43.24 
 
 
179 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  44.13 
 
 
181 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  46.89 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  44.83 
 
 
186 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  41.76 
 
 
186 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  41.9 
 
 
189 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  43.01 
 
 
181 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  44.26 
 
 
192 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  43.33 
 
 
188 aa  141  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  44.13 
 
 
192 aa  141  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  42.7 
 
 
188 aa  140  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  44 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  44.89 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  41.9 
 
 
189 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  43.02 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  44.2 
 
 
187 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  40.8 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  41.48 
 
 
189 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  41.99 
 
 
189 aa  137  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  44.44 
 
 
189 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  41.62 
 
 
187 aa  137  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  43.41 
 
 
194 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  42.44 
 
 
189 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  42.62 
 
 
189 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  44.44 
 
 
189 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  40.11 
 
 
186 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  43.68 
 
 
191 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  43.02 
 
 
185 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5584  PfpI family intracellular peptidase  42.46 
 
 
195 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  42.86 
 
 
189 aa  134  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  43.72 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  42.16 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  42.08 
 
 
180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  41.81 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  45.14 
 
 
187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  44.26 
 
 
186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  40.98 
 
 
190 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  41.53 
 
 
179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  41.14 
 
 
190 aa  131  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  44.38 
 
 
182 aa  131  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.42 
 
 
175 aa  130  9e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  41.53 
 
 
192 aa  130  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  40.22 
 
 
188 aa  130  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  40.56 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  40.44 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  41.9 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  40 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  40.98 
 
 
179 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  40.98 
 
 
179 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  40.44 
 
 
180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  42.08 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  40.98 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  41.62 
 
 
189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  40.98 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  41.53 
 
 
190 aa  128  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  38.8 
 
 
190 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  42.08 
 
 
182 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  42.08 
 
 
182 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0077  peptidase C56, PfpI  40.24 
 
 
174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0445898  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  41.48 
 
 
179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  39.11 
 
 
183 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  42.37 
 
 
194 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  41.21 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  40.46 
 
 
182 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  38.55 
 
 
183 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  39.78 
 
 
245 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  46.3 
 
 
179 aa  120  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  41.9 
 
 
178 aa  120  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  35.8 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  39.44 
 
 
241 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  37.99 
 
 
183 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  38.92 
 
 
177 aa  117  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  38.73 
 
 
182 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  40.83 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>