More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0077 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0077  peptidase C56, PfpI  100 
 
 
174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0445898  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  62.43 
 
 
175 aa  230  6e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  45.93 
 
 
199 aa  157  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  43.35 
 
 
194 aa  154  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  44.71 
 
 
182 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  44.71 
 
 
182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  45.93 
 
 
180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  45.93 
 
 
179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  45.66 
 
 
179 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  44.05 
 
 
182 aa  144  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  41.92 
 
 
189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  44.77 
 
 
180 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  43.9 
 
 
188 aa  143  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  44.44 
 
 
185 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  43.45 
 
 
185 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  42.26 
 
 
197 aa  142  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  43.9 
 
 
186 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  43.86 
 
 
189 aa  141  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  39.88 
 
 
178 aa  141  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  44.77 
 
 
180 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  44.19 
 
 
179 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  42.68 
 
 
188 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  41.18 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  42.59 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  43.68 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  42.26 
 
 
187 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  43.29 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  42.11 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  42.11 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  42.59 
 
 
183 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  42.26 
 
 
187 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  42.77 
 
 
179 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  40.49 
 
 
191 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  42.42 
 
 
189 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  41.52 
 
 
182 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  43.1 
 
 
193 aa  136  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  40.96 
 
 
204 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  42.17 
 
 
194 aa  136  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  39.31 
 
 
188 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  39.31 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  43.9 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  38.69 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  43.21 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  41.98 
 
 
182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31560  intracellular protease, PfpI family  40.23 
 
 
184 aa  134  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.568268  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  39.31 
 
 
188 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  39.29 
 
 
185 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  39.29 
 
 
185 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  39.29 
 
 
185 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  38.46 
 
 
190 aa  134  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  40.36 
 
 
186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  40.85 
 
 
187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  42.26 
 
 
186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  38.1 
 
 
181 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  38.69 
 
 
188 aa  132  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  38.1 
 
 
187 aa  131  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  40.24 
 
 
179 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  42.26 
 
 
186 aa  130  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  40.83 
 
 
188 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  39.33 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  39.02 
 
 
204 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  41.98 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  39.64 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  40.85 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  38.15 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  39.08 
 
 
183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  38.79 
 
 
186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  39.39 
 
 
183 aa  127  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1647  PfpI family intracellular peptidase  40.11 
 
 
186 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.920714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  39.53 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0922  putative protease  39.77 
 
 
187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  39.63 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09940  putative protease  40.24 
 
 
187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253725  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  38.32 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  37.8 
 
 
187 aa  125  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6770  intracellular protease, PfpI family  40.11 
 
 
182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21709  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  37.35 
 
 
186 aa  124  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  38.95 
 
 
183 aa  124  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  38.89 
 
 
189 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0410  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  39.08 
 
 
182 aa  123  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.532104  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  36.53 
 
 
189 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3335  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.58 
 
 
194 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  37.8 
 
 
187 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  37.72 
 
 
189 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  35.26 
 
 
168 aa  121  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  39.05 
 
 
168 aa  121  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  37.65 
 
 
190 aa  121  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  37.28 
 
 
192 aa  120  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  36.09 
 
 
192 aa  120  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  36.69 
 
 
192 aa  120  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  36.69 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  39.75 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  34.32 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  38.6 
 
 
190 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  34.91 
 
 
189 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  35.98 
 
 
182 aa  117  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1963  PfpI family intracellular peptidase  39.08 
 
 
171 aa  117  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710922  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  35.5 
 
 
192 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1929  PfpI family intracellular peptidase  39.08 
 
 
171 aa  117  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  37.85 
 
 
192 aa  117  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>