More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5013 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  71.35 
 
 		 185 aa  267  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  63.07 
 
 		 189 aa  238  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  60.12 
 
 		 189 aa  219  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  60.23 
 
 		 183 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  60.34 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  56.98 
 
 		 186 aa  208  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  58.93 
 
 		 187 aa  208  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  53.55 
 
 		 197 aa  206  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  57.8 
 
 		 190 aa  204  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  54.35 
 
 		 190 aa  203  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  57.71 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  54.6 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  54.6 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  54.6 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  52.2 
 
 		 183 aa  197  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  52.38 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  54.76 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  57.89 
 
 		 183 aa  193  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  57.06 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  52.54 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  50 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  55.42 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  53.57 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  52.33 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  48.65 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  53.41 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  53.41 
 
 		 179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  52.27 
 
 		 189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  51.15 
 
 		 188 aa  188  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  52.57 
 
 		 182 aa  188  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  50.84 
 
 		 188 aa  188  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  51.05 
 
 		 189 aa  187  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  54.24 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  53.98 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  57.83 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  49.43 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  52.57 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  52.33 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  48.9 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  50 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  52.73 
 
 		 182 aa  182  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  52.38 
 
 		 182 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  49.42 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  49.42 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  51.79 
 
 		 182 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  48.84 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  50 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  50 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  51.19 
 
 		 182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  52.25 
 
 		 181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  51.19 
 
 		 182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  51.19 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5584  PfpI family intracellular peptidase  55.06 
 
 		 195 aa  178  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  45.98 
 
 		 181 aa  176  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  47.09 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  48.21 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  50 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  49.18 
 
 		 182 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  48.26 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  50.31 
 
 		 193 aa  175  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  47.65 
 
 		 186 aa  175  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  48.84 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  47.02 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  50 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3335  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.92 
 
 		 194 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  50 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  49.11 
 
 		 192 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  50 
 
 		 189 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  44.32 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  47.88 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6770  intracellular protease, PfpI family  50 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21709  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  48.81 
 
 		 189 aa  167  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  50.29 
 
 		 189 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  47.34 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  47.16 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  47.34 
 
 		 192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  44.69 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  47.16 
 
 		 189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  46.15 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  46.59 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  46.33 
 
 		 245 aa  161  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  46.67 
 
 		 190 aa  161  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  44.38 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  48.15 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  51.92 
 
 		 193 aa  158  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  45.45 
 
 		 190 aa  157  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  46.71 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  46.24 
 
 		 241 aa  153  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.07 
 
 		 175 aa  152  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0228  intracellular protease, PfpI family  46.63 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  46.24 
 
 		 178 aa  151  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  40.56 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  46.91 
 
 		 188 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  46.91 
 
 		 188 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  47.83 
 
 		 168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  45.68 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  44.38 
 
 		 172 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1647  PfpI family intracellular peptidase  43.78 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.920714 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31560  intracellular protease, PfpI family  44.83 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.568268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>