More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0410 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0410  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.532104  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0228  intracellular protease, PfpI family  47.43 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0922  putative protease  46.11 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31560  intracellular protease, PfpI family  45 
 
 		 184 aa  155  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.568268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1647  PfpI family intracellular peptidase  45 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.920714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09940  putative protease  45 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17170  intracellular protease, PfpI family  43.82 
 
 		 197 aa  147  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  40.46 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6770  intracellular protease, PfpI family  41.34 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21709  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.81 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  41.14 
 
 		 189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  39.89 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  40.57 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  40.12 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  38.01 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  38.86 
 
 		 186 aa  124  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  38.82 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0077  peptidase C56, PfpI  39.08 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0445898  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  42.46 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  36.26 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  36.72 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  42.46 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  39.44 
 
 		 186 aa  120  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  38.25 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  35.59 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  36.42 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  41.9 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  41.9 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  42.54 
 
 		 189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  38.61 
 
 		 184 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  38.92 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  41.9 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  36.42 
 
 		 191 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  37.22 
 
 		 179 aa  118  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  35.03 
 
 		 189 aa  117  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  38.6 
 
 		 183 aa  117  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  37.87 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  36.11 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  38.25 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  39.34 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  37.29 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  35.75 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  35.75 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  35.75 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  35.09 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  39.16 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  38.01 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  36.78 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  33.33 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  39.43 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  37.43 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  37.87 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  36 
 
 		 187 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  39.87 
 
 		 179 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  37.79 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  36.63 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  38.41 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  39.08 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  38.65 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  36.52 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  40.56 
 
 		 168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  38.01 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  39.18 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  38.55 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  40.72 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  36.11 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  38.46 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  37.14 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  34.83 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  38.46 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  40.51 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  36.16 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  39.05 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  36.11 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  36.05 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  38.6 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  36.07 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  39.51 
 
 		 183 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  34.64 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  38.04 
 
 		 186 aa  107  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  32.2 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  37.58 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  33.15 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  37.43 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  35.47 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  35.36 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  33.89 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  39.24 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  40.37 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  39.75 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  39.75 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  34.46 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  34.64 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  34.43 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  37.85 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  34.88 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  35.39 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5584  PfpI family intracellular peptidase  31.98 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  34.05 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  35.71 
 
 		 179 aa  98.6  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>