More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5375 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  100 
 
 
192 aa  387  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  82.29 
 
 
192 aa  328  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  81.25 
 
 
192 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  80.73 
 
 
192 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  76.34 
 
 
190 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  74.05 
 
 
190 aa  293  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  59.26 
 
 
186 aa  234  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  60.64 
 
 
186 aa  231  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  59.46 
 
 
186 aa  230  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  59.12 
 
 
187 aa  227  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  59.12 
 
 
187 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  57.84 
 
 
187 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  58.01 
 
 
187 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  56.91 
 
 
186 aa  222  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  53.37 
 
 
186 aa  198  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  53.93 
 
 
189 aa  198  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  54.1 
 
 
194 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  52.25 
 
 
193 aa  195  4.0000000000000005e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  50.81 
 
 
197 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  50 
 
 
204 aa  185  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  49.45 
 
 
183 aa  184  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  50 
 
 
182 aa  184  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  48.02 
 
 
181 aa  171  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  42.11 
 
 
189 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  44.62 
 
 
188 aa  168  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  48.88 
 
 
183 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  46.78 
 
 
185 aa  164  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  44.62 
 
 
188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  45.76 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  46.15 
 
 
191 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  46.37 
 
 
194 aa  162  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  44.81 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  44.09 
 
 
187 aa  158  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  44.26 
 
 
189 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  41.36 
 
 
190 aa  157  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  46.02 
 
 
190 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  42.62 
 
 
189 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  42.7 
 
 
177 aa  155  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  45.45 
 
 
189 aa  154  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  42.7 
 
 
179 aa  153  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  44.89 
 
 
189 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  44.89 
 
 
189 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  44.32 
 
 
181 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  43.24 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  46.51 
 
 
189 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  44.71 
 
 
186 aa  148  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  43.02 
 
 
182 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  43.02 
 
 
182 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  44 
 
 
183 aa  148  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  41.62 
 
 
182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  43.02 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  39.88 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  42.86 
 
 
183 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31560  intracellular protease, PfpI family  47.19 
 
 
184 aa  145  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.568268  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  41.62 
 
 
180 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  43.43 
 
 
189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  41.9 
 
 
182 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  41.9 
 
 
182 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  41.62 
 
 
184 aa  143  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  44.32 
 
 
192 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17170  intracellular protease, PfpI family  46.99 
 
 
197 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816249  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  40.46 
 
 
180 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  44.32 
 
 
178 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  40.54 
 
 
182 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  42.77 
 
 
189 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  40 
 
 
180 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  41.71 
 
 
183 aa  141  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  40 
 
 
179 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  40 
 
 
199 aa  141  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  41.24 
 
 
245 aa  140  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  40.46 
 
 
179 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  43.65 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  43.65 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  43.65 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  41.85 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  45.09 
 
 
182 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  44.75 
 
 
185 aa  138  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  43.35 
 
 
181 aa  137  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  41.57 
 
 
188 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  41.81 
 
 
188 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  39.66 
 
 
241 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  41.95 
 
 
167 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  41.21 
 
 
189 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  41.81 
 
 
188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  40.66 
 
 
189 aa  134  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  35.84 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  40.68 
 
 
188 aa  133  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  39.43 
 
 
183 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0228  intracellular protease, PfpI family  45.25 
 
 
185 aa  131  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  41.52 
 
 
168 aa  131  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  39.41 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09940  putative protease  41.53 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253725  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3335  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.24 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  38.95 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  37.08 
 
 
172 aa  129  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5584  PfpI family intracellular peptidase  40.56 
 
 
195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  41.32 
 
 
179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  38.3 
 
 
186 aa  128  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  40.12 
 
 
179 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  36.26 
 
 
187 aa  127  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>