More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2955 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  55.91 
 
 
193 aa  224  6e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  55.38 
 
 
189 aa  224  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  57.92 
 
 
186 aa  223  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  55.61 
 
 
187 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  54.55 
 
 
187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  52.94 
 
 
187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  54.64 
 
 
183 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  55.87 
 
 
182 aa  209  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  52.69 
 
 
189 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  54.59 
 
 
186 aa  208  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  53.01 
 
 
187 aa  207  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  54.89 
 
 
194 aa  204  8e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  52.2 
 
 
186 aa  204  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  50.8 
 
 
187 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  55.17 
 
 
186 aa  204  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  53.93 
 
 
190 aa  201  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  52.2 
 
 
188 aa  198  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  53.93 
 
 
192 aa  197  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  53.93 
 
 
192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  53.93 
 
 
192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  50.55 
 
 
188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  54.76 
 
 
191 aa  193  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  51.12 
 
 
190 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  52.97 
 
 
187 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  53.19 
 
 
190 aa  191  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  49.73 
 
 
197 aa  191  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  48.6 
 
 
181 aa  187  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  51.35 
 
 
194 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  51.15 
 
 
179 aa  186  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  50 
 
 
192 aa  185  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  50 
 
 
190 aa  184  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  49.45 
 
 
185 aa  184  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  46.93 
 
 
186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  50 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  44.94 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  48.09 
 
 
188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  51.12 
 
 
189 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  48.04 
 
 
181 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  49.45 
 
 
189 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  49.17 
 
 
189 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  49.15 
 
 
177 aa  169  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  47.51 
 
 
189 aa  167  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  48.07 
 
 
189 aa  167  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  48.9 
 
 
189 aa  167  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  49.17 
 
 
193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  44.83 
 
 
182 aa  164  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  47.51 
 
 
189 aa  164  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  45.2 
 
 
180 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  48.24 
 
 
182 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  43.65 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  44.69 
 
 
180 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  48.28 
 
 
186 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  48.24 
 
 
182 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  48.24 
 
 
182 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  48.07 
 
 
183 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  48.24 
 
 
182 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  47.65 
 
 
182 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  45.71 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  44.13 
 
 
179 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  42.53 
 
 
199 aa  160  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  42.7 
 
 
179 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  44.2 
 
 
183 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  45.9 
 
 
183 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  48.33 
 
 
189 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  44.69 
 
 
183 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  49.45 
 
 
188 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  44.38 
 
 
179 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  45.03 
 
 
189 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  43.1 
 
 
182 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  43.58 
 
 
185 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  43.58 
 
 
185 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  43.58 
 
 
185 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  42.7 
 
 
180 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  43.82 
 
 
179 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  44.63 
 
 
186 aa  154  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  43.9 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  46.55 
 
 
178 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  45.93 
 
 
184 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  42.7 
 
 
179 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  44.69 
 
 
185 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  44.02 
 
 
189 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5584  PfpI family intracellular peptidase  45.3 
 
 
195 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  41.08 
 
 
187 aa  148  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  44.77 
 
 
182 aa  147  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0228  intracellular protease, PfpI family  45.14 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  45.6 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31560  intracellular protease, PfpI family  43.72 
 
 
184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.568268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  44.89 
 
 
181 aa  144  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.82 
 
 
175 aa  144  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  42.44 
 
 
245 aa  142  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  43.86 
 
 
172 aa  141  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1647  PfpI family intracellular peptidase  45.9 
 
 
186 aa  141  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.920714 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  44.77 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  45.93 
 
 
174 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  40.59 
 
 
168 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  44.19 
 
 
188 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  44.19 
 
 
188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  45.83 
 
 
172 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  45.83 
 
 
172 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>