More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2033 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  100 
 
 		 173 aa  359  9e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  49.7 
 
 		 168 aa  189  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  51.81 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  51.74 
 
 		 174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  52.66 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0594  intracellular protease, PfpI family  50.3 
 
 		 174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00956999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  50.3 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  44.77 
 
 		 172 aa  174  6e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  50.31 
 
 		 172 aa  174  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  43.98 
 
 		 170 aa  168  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1713  intracellular protease, PfpI family  49.1 
 
 		 174 aa  167  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00460546  normal  0.198806 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  41.67 
 
 		 227 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1524  ThiJ/PfpI domain protein  43.03 
 
 		 180 aa  156  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.447561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  44.24 
 
 		 168 aa  151  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  45.4 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2922  ThiJ/PfpI domain protein  43.12 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0699606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1052  intracellular protease, PfpI family  43.71 
 
 		 167 aa  149  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.426271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  44.17 
 
 		 188 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  44.17 
 
 		 188 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  43.18 
 
 		 187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  43.56 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  39.77 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  42.11 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  43.86 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0105  ThiJ/PfpI domain protein  41.18 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438693  normal  0.815938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  41.92 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  41.82 
 
 		 364 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  41.46 
 
 		 168 aa  141  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  42.17 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  41.71 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  41.46 
 
 		 366 aa  139  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2580  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  43.27 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  42.37 
 
 		 186 aa  138  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  41.98 
 
 		 172 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  41.98 
 
 		 172 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  41.98 
 
 		 172 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  40.59 
 
 		 186 aa  137  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  41.98 
 
 		 172 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  41.36 
 
 		 172 aa  137  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  41.98 
 
 		 172 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  39.76 
 
 		 167 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  41.36 
 
 		 172 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  41.36 
 
 		 172 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  41.36 
 
 		 172 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  41.36 
 
 		 172 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  41.36 
 
 		 172 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  41.36 
 
 		 172 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  41.36 
 
 		 172 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  41.36 
 
 		 172 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  42.51 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1220  ThiJ/PfpI  40.59 
 
 		 172 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  40.35 
 
 		 186 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  42.51 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  38.32 
 
 		 184 aa  135  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  40.57 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  39.2 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  41.98 
 
 		 172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2403  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.82 
 
 		 174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  40.96 
 
 		 167 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  41.67 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  40.23 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  41.95 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  40.7 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  37.72 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  40.35 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  40.59 
 
 		 186 aa  131  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  43.95 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  39.05 
 
 		 204 aa  131  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  40.12 
 
 		 197 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  42.13 
 
 		 192 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  38.95 
 
 		 193 aa  130  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  40.49 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  40.23 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  37.42 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  42.6 
 
 		 191 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  41.04 
 
 		 189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  37.29 
 
 		 181 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  41.52 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  39.13 
 
 		 363 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  41.38 
 
 		 189 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  40.8 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2828  peptidase C56, PfpI  38.46 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  40.23 
 
 		 189 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  42.11 
 
 		 189 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  39.18 
 
 		 190 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  38.51 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  39.66 
 
 		 188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  40.12 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  40.94 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  40.94 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  40.94 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  39.53 
 
 		 245 aa  124  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  39.53 
 
 		 181 aa  124  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  41.38 
 
 		 189 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  39.41 
 
 		 190 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  40.45 
 
 		 189 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  38.37 
 
 		 178 aa  124  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  34.94 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  37.35 
 
 		 168 aa  124  9e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>