More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2403 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2403  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
174 aa  345  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0105  ThiJ/PfpI domain protein  90.8 
 
 
174 aa  310  4.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438693  normal  0.815938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2580  ThiJ/PfpI domain-containing protein  87.86 
 
 
174 aa  302  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1220  ThiJ/PfpI  66.47 
 
 
172 aa  225  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  48.52 
 
 
173 aa  152  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  47.09 
 
 
204 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1713  intracellular protease, PfpI family  45.56 
 
 
174 aa  151  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00460546  normal  0.198806 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  47.34 
 
 
174 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0594  intracellular protease, PfpI family  48.81 
 
 
174 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00956999 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  39.18 
 
 
172 aa  144  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1524  ThiJ/PfpI domain protein  44.87 
 
 
180 aa  134  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.447561  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  38.82 
 
 
173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  40.83 
 
 
172 aa  134  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  40 
 
 
168 aa  121  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  36.84 
 
 
227 aa  121  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  37.28 
 
 
173 aa  119  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  36.31 
 
 
170 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  38.51 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  38.86 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  35.12 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  39.2 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  40.51 
 
 
169 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  37.87 
 
 
172 aa  114  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  37.43 
 
 
187 aa  114  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  40.11 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  39.87 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  38.07 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  36.08 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  38.51 
 
 
167 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  39.13 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  38.51 
 
 
179 aa  111  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  37.13 
 
 
364 aa  111  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  36.36 
 
 
197 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  37.72 
 
 
366 aa  110  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  40 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  38.82 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  37.35 
 
 
168 aa  108  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  38.51 
 
 
204 aa  108  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  37.35 
 
 
364 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  38.73 
 
 
179 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  38.37 
 
 
181 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  39.05 
 
 
188 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  36.57 
 
 
189 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  37.95 
 
 
189 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  34.34 
 
 
168 aa  106  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  36.14 
 
 
363 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  38.55 
 
 
180 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  39.43 
 
 
189 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  37.99 
 
 
179 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  36.02 
 
 
169 aa  105  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  37.93 
 
 
180 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  37.29 
 
 
189 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2922  ThiJ/PfpI domain protein  36.2 
 
 
167 aa  105  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0699606  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  37.28 
 
 
188 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  38.25 
 
 
188 aa  104  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  35.54 
 
 
168 aa  104  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  35.23 
 
 
188 aa  104  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.16 
 
 
242 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.643562  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  36.93 
 
 
183 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  34.66 
 
 
187 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  36.99 
 
 
245 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  36.57 
 
 
180 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  35.29 
 
 
184 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  37.36 
 
 
179 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  38.64 
 
 
241 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  33.54 
 
 
166 aa  100  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  36.59 
 
 
172 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  36.59 
 
 
172 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  36.59 
 
 
172 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  36.59 
 
 
172 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  37.71 
 
 
183 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  35.26 
 
 
193 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  36.59 
 
 
172 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  34.09 
 
 
187 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  36.42 
 
 
184 aa  99  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  35.43 
 
 
192 aa  99  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  34.09 
 
 
187 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  36.72 
 
 
182 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  37.64 
 
 
190 aa  98.6  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  34.09 
 
 
187 aa  98.2  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  36.72 
 
 
182 aa  98.2  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  40.94 
 
 
191 aa  98.2  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1929  PfpI family intracellular peptidase  36.84 
 
 
171 aa  97.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  33.9 
 
 
186 aa  97.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1963  PfpI family intracellular peptidase  36.84 
 
 
171 aa  97.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710922  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  35.75 
 
 
186 aa  97.8  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2828  peptidase C56, PfpI  37.04 
 
 
179 aa  97.4  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1052  intracellular protease, PfpI family  30.91 
 
 
167 aa  97.1  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.426271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  34.86 
 
 
181 aa  97.1  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  34.86 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  34.86 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  34.86 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  34.88 
 
 
177 aa  95.9  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  34.66 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  37.5 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  36.36 
 
 
190 aa  95.5  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  36.67 
 
 
182 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0228  intracellular protease, PfpI family  37.99 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  37.5 
 
 
189 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  36.67 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>