More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1713 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1713  intracellular protease, PfpI family  100 
 
 		 174 aa  359  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00460546  normal  0.198806 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  66.27 
 
 		 204 aa  239  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0594  intracellular protease, PfpI family  65.5 
 
 		 174 aa  236  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00956999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  64.94 
 
 		 174 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  62.5 
 
 		 173 aa  220  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  55.88 
 
 		 172 aa  195  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1524  ThiJ/PfpI domain protein  52.12 
 
 		 180 aa  172  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.447561  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  49.1 
 
 		 173 aa  167  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  44.71 
 
 		 172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  44.51 
 
 		 227 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  43.79 
 
 		 170 aa  154  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  43.11 
 
 		 170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2580  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.34 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2403  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.56 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  42.33 
 
 		 168 aa  144  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0105  ThiJ/PfpI domain protein  44.19 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438693  normal  0.815938 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1220  ThiJ/PfpI  43.53 
 
 		 172 aa  141  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  42.11 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  41.57 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  42.94 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  41.57 
 
 		 188 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  39.18 
 
 		 173 aa  134  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  40.46 
 
 		 183 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  41.92 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1052  intracellular protease, PfpI family  35.8 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.426271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  40.57 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  40.83 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  39.76 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  41.14 
 
 		 179 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  41.86 
 
 		 189 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  38.55 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  41.38 
 
 		 189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  40.23 
 
 		 187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  41.38 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  41.94 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  40.12 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  39.41 
 
 		 186 aa  124  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  37.06 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  39.55 
 
 		 182 aa  121  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  38.69 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  38.29 
 
 		 185 aa  120  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  38.64 
 
 		 183 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  39.53 
 
 		 182 aa  120  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  38.71 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  39.41 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  39.41 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  39.78 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  39.43 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  40.68 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  41.04 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  39.41 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  41.76 
 
 		 245 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  39.41 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  40.59 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  38.29 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  37.14 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  40.59 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  38.6 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  39.44 
 
 		 192 aa  117  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  39.18 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  40.12 
 
 		 168 aa  117  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  38.6 
 
 		 190 aa  117  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  38.98 
 
 		 182 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2922  ThiJ/PfpI domain protein  39.74 
 
 		 167 aa  117  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0699606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  38.37 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  36.93 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  38.37 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  37.72 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  38.37 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  38.51 
 
 		 183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  39.31 
 
 		 189 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  36.67 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  35.43 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  38.22 
 
 		 169 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  38.01 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  37.95 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  37.14 
 
 		 180 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  39.35 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  38.24 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  40.59 
 
 		 241 aa  114  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  37.5 
 
 		 179 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  38.22 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  36.2 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  37.43 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  37.57 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  37.14 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  37.14 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  37.14 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  40.12 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  38.61 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  38.15 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  38.98 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  39.18 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  36.36 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  36.93 
 
 		 179 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  33.72 
 
 		 186 aa  110  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  36.99 
 
 		 204 aa  110  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  38.1 
 
 		 193 aa  110  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  37.85 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  38.04 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>