More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1318 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  47.62 
 
 		 172 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  49.08 
 
 		 168 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  45.83 
 
 		 172 aa  170  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  46.99 
 
 		 170 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  45.24 
 
 		 204 aa  161  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  43.02 
 
 		 174 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  41.67 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1713  intracellular protease, PfpI family  44.51 
 
 		 174 aa  155  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00460546  normal  0.198806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0594  intracellular protease, PfpI family  44.44 
 
 		 174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00956999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  41.67 
 
 		 173 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  43.56 
 
 		 170 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1524  ThiJ/PfpI domain protein  40.38 
 
 		 180 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.447561  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  39.64 
 
 		 364 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1052  intracellular protease, PfpI family  39.76 
 
 		 167 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.426271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2580  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.18 
 
 		 174 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0105  ThiJ/PfpI domain protein  36.9 
 
 		 174 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438693  normal  0.815938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  34.91 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  37.65 
 
 		 366 aa  122  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  35.52 
 
 		 184 aa  122  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2403  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.84 
 
 		 174 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2922  ThiJ/PfpI domain protein  36.97 
 
 		 167 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0699606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  35.44 
 
 		 172 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  37.13 
 
 		 173 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  39.16 
 
 		 364 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1220  ThiJ/PfpI  37.57 
 
 		 172 aa  118  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  34.68 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  36.47 
 
 		 188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  37.13 
 
 		 188 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  35.47 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  35.8 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  34.9 
 
 		 192 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  33.7 
 
 		 190 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  36.47 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  34.38 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  35.98 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  34.38 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  35.88 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  34.12 
 
 		 187 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  35.84 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  37.35 
 
 		 168 aa  112  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  34.3 
 
 		 182 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  36.09 
 
 		 187 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  38.85 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  38.82 
 
 		 183 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  33.53 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  36.05 
 
 		 189 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  35.93 
 
 		 168 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  34.91 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  34.29 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  34.81 
 
 		 168 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  35.4 
 
 		 172 aa  108  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  34.16 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  34.16 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  34.16 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  34.16 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  33.7 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  34.13 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  34.16 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  32.54 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  34.78 
 
 		 166 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  33.92 
 
 		 182 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  33.68 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  36.53 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  36.63 
 
 		 182 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  34.12 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  36.63 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  34.88 
 
 		 172 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  33.73 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  31.29 
 
 		 166 aa  102  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  31.58 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  36.31 
 
 		 167 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  34.16 
 
 		 172 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  33.73 
 
 		 189 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  31.21 
 
 		 180 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  34.16 
 
 		 172 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  34.16 
 
 		 172 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  34.16 
 
 		 172 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  34.16 
 
 		 172 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  34.16 
 
 		 172 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  35.67 
 
 		 182 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  34.16 
 
 		 172 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  35.67 
 
 		 182 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  34.16 
 
 		 172 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  34.16 
 
 		 172 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  35.67 
 
 		 182 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.02 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  35.23 
 
 		 178 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  31.77 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  35.76 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  33.33 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1929  PfpI family intracellular peptidase  33.33 
 
 		 171 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  33.16 
 
 		 186 aa  99.8  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1963  PfpI family intracellular peptidase  33.33 
 
 		 171 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710922  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  35.88 
 
 		 183 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  36.99 
 
 		 183 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  35.29 
 
 		 194 aa  99.4  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  34.09 
 
 		 189 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  31.25 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  32.37 
 
 		 185 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>