More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2623 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 242 aa  504  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  38.02 
 
 		 185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  38.02 
 
 		 185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  38.02 
 
 		 185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  37.7 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  36.7 
 
 		 181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  36.73 
 
 		 194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  35.64 
 
 		 197 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  35.94 
 
 		 182 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  37.77 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  35.42 
 
 		 189 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  35.64 
 
 		 204 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  37.5 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  37.1 
 
 		 192 aa  125  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  35.79 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  34.52 
 
 		 186 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  35.11 
 
 		 187 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  34.22 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  36.02 
 
 		 192 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  35.42 
 
 		 193 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  35.94 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  32.98 
 
 		 185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  36.36 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  34.39 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  31.47 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  34.22 
 
 		 183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  34.05 
 
 		 172 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  33.69 
 
 		 182 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  34.21 
 
 		 179 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  32.32 
 
 		 186 aa  118  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  33.16 
 
 		 179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  33.16 
 
 		 179 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  32.63 
 
 		 180 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  31.31 
 
 		 190 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  33.87 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  33.16 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  32.63 
 
 		 179 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  34.22 
 
 		 168 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  32.63 
 
 		 180 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  31.22 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  34.74 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  30.37 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  36.02 
 
 		 190 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  33.87 
 
 		 186 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  33.51 
 
 		 186 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  35.42 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  34.04 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  32.11 
 
 		 180 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  34.55 
 
 		 187 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  33.51 
 
 		 179 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  34.74 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  31.22 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  32.8 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  34.57 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  35.08 
 
 		 364 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  32.8 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  32.26 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  34.05 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  31.75 
 
 		 179 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  32.11 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  35.83 
 
 		 168 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  31.77 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  34.57 
 
 		 189 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  30.81 
 
 		 182 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  32.62 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  31.75 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  36.02 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  32.98 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  33.33 
 
 		 183 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  31.25 
 
 		 183 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  30.21 
 
 		 183 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  31.35 
 
 		 182 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  31.35 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  30.61 
 
 		 188 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4439  intracellular protease 1  33.69 
 
 		 171 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.831334  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  30.53 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  31.63 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  33.16 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  29.47 
 
 		 170 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  31.22 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0753  PfpI family intracellular peptidase  33.16 
 
 		 171 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2403  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.16 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  33.87 
 
 		 366 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  33.16 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  29.73 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  30.81 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  30.81 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0802  thiJ/pfpI family protein  32.98 
 
 		 171 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  31.02 
 
 		 181 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0842  thiJ/pfpI family protein  32.98 
 
 		 171 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  29.19 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0935  thiJ/pfpI family protein  32.62 
 
 		 171 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  31.35 
 
 		 182 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  32.12 
 
 		 363 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0751  protease I, ThiJ/PfpI family protein  32.98 
 
 		 171 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0938  thiJ/pfpI family protein  32.98 
 
 		 171 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000935342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2580  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.58 
 
 		 174 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  33.69 
 
 		 172 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  30.43 
 
 		 189 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  30.65 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>