More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2130 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  100 
 
 
184 aa  374  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  66.67 
 
 
168 aa  234  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  65.48 
 
 
172 aa  227  7e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0935  thiJ/pfpI family protein  55.09 
 
 
171 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0938  thiJ/pfpI family protein  54.17 
 
 
171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000935342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  53.89 
 
 
171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0802  thiJ/pfpI family protein  54.76 
 
 
171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0751  protease I, ThiJ/PfpI family protein  54.17 
 
 
171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0746  protease I, ThiJ/PfpI family protein  54.49 
 
 
171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0842  thiJ/pfpI family protein  54.76 
 
 
171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0753  PfpI family intracellular peptidase  54.49 
 
 
171 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  56.89 
 
 
172 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  56.89 
 
 
172 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  56.89 
 
 
172 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  56.89 
 
 
172 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  56.89 
 
 
172 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4439  intracellular protease 1  53.29 
 
 
171 aa  193  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.831334  normal  0.103801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  54.49 
 
 
172 aa  187  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  54.49 
 
 
172 aa  187  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  54.49 
 
 
172 aa  187  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  54.49 
 
 
172 aa  187  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  54.49 
 
 
172 aa  187  9e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  54.49 
 
 
172 aa  187  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  54.49 
 
 
172 aa  187  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  53.89 
 
 
172 aa  185  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  53.29 
 
 
172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  52.69 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  45.11 
 
 
188 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  44.57 
 
 
188 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  45.51 
 
 
188 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  45.56 
 
 
189 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  43.71 
 
 
168 aa  155  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  41.67 
 
 
168 aa  154  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  45.25 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  48.26 
 
 
189 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  48.28 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  47.09 
 
 
189 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  43.27 
 
 
187 aa  144  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  41.94 
 
 
189 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  41.3 
 
 
197 aa  143  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  41.28 
 
 
186 aa  141  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  36.75 
 
 
364 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  47.31 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  39.05 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  45.65 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  39.05 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  40.91 
 
 
185 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  40.91 
 
 
185 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  40.91 
 
 
185 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  42.53 
 
 
189 aa  138  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  37.35 
 
 
366 aa  138  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  42.44 
 
 
204 aa  137  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  44.24 
 
 
182 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  43.9 
 
 
181 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  42.7 
 
 
189 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  41.62 
 
 
186 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  41.11 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  41.86 
 
 
182 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  42.44 
 
 
190 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  38.32 
 
 
173 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  39.02 
 
 
167 aa  134  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  39.53 
 
 
193 aa  134  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  44.77 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  34.52 
 
 
363 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3335  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.01 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  44.77 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  42.58 
 
 
169 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  42.58 
 
 
169 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  38.32 
 
 
172 aa  132  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  38.95 
 
 
183 aa  131  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1963  PfpI family intracellular peptidase  37.87 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710922  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  39.34 
 
 
241 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1929  PfpI family intracellular peptidase  37.87 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  41.76 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  41.07 
 
 
167 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  43.18 
 
 
189 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  43.29 
 
 
191 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  38.46 
 
 
172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  39.77 
 
 
185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  40.49 
 
 
185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  38.69 
 
 
174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  42.77 
 
 
182 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  41.62 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  42.29 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  42.17 
 
 
182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  38.51 
 
 
245 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  44.1 
 
 
193 aa  125  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  40.24 
 
 
167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  38.27 
 
 
188 aa  125  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2922  ThiJ/PfpI domain protein  38.01 
 
 
167 aa  125  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0699606  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  35.54 
 
 
364 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  34.68 
 
 
181 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  42.24 
 
 
179 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  35.15 
 
 
170 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  42.24 
 
 
179 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  38.6 
 
 
188 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1052  intracellular protease, PfpI family  37.87 
 
 
167 aa  122  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.426271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  43.21 
 
 
181 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  40.12 
 
 
180 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  38.32 
 
 
173 aa  122  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>