More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1574 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  100 
 
 		 241 aa  471  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  75 
 
 		 245 aa  353  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  49.15 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  44.94 
 
 		 183 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  43.24 
 
 		 189 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  45.81 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  47.98 
 
 		 189 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  47.7 
 
 		 181 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  43.18 
 
 		 179 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  41.15 
 
 		 197 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  43.68 
 
 		 179 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  46.29 
 
 		 181 aa  165  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  45.71 
 
 		 187 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  47.93 
 
 		 182 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  46.81 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  46.47 
 
 		 183 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  47.31 
 
 		 185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  46.32 
 
 		 189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  47.31 
 
 		 185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  47.31 
 
 		 185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  47.34 
 
 		 182 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  46.89 
 
 		 186 aa  162  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  47.9 
 
 		 182 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  47.9 
 
 		 182 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  45.2 
 
 		 184 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  47.13 
 
 		 179 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  46.02 
 
 		 187 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  44.89 
 
 		 190 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  47.9 
 
 		 182 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  46.71 
 
 		 179 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  43.43 
 
 		 183 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  44.2 
 
 		 186 aa  158  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  44 
 
 		 183 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  41.62 
 
 		 189 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  46.24 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  43.43 
 
 		 180 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  46.24 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  43.75 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  48.28 
 
 		 182 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  46.32 
 
 		 185 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  44.81 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  42.29 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  42.86 
 
 		 179 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  41.62 
 
 		 193 aa  152  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  43.02 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  42.2 
 
 		 180 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6770  intracellular protease, PfpI family  46.86 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  42.46 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  41.04 
 
 		 180 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  46.89 
 
 		 189 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  42.33 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  42.33 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  45.99 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  42.53 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  41.34 
 
 		 187 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  45.25 
 
 		 181 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  45.76 
 
 		 189 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  43.18 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  41.27 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  45.51 
 
 		 183 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  41.04 
 
 		 179 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  43.86 
 
 		 186 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  40.78 
 
 		 187 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  39.11 
 
 		 188 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  41.48 
 
 		 182 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  42.29 
 
 		 182 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  42.86 
 
 		 177 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  42.22 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  44.51 
 
 		 189 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  43.43 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  45.2 
 
 		 189 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  41.24 
 
 		 194 aa  142  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  42.31 
 
 		 188 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  41.52 
 
 		 186 aa  141  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  38.42 
 
 		 188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  37.5 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  40.22 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  41.34 
 
 		 190 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  46.67 
 
 		 193 aa  138  7.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  43.01 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  42.2 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  44.91 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  41.14 
 
 		 179 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  39.66 
 
 		 192 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  41.34 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  45.45 
 
 		 189 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  43.67 
 
 		 167 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  43.01 
 
 		 189 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  43.71 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  39.26 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  36.26 
 
 		 168 aa  130  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  39.34 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  37.5 
 
 		 168 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  40.8 
 
 		 188 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  42.41 
 
 		 169 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  39.05 
 
 		 168 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  40.7 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  40.7 
 
 		 188 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  37.91 
 
 		 189 aa  125  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0922  putative protease  40.78 
 
 		 187 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>