More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1234 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  100 
 
 		 204 aa  418  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0594  intracellular protease, PfpI family  84.3 
 
 		 174 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00956999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  75.88 
 
 		 173 aa  267  8.999999999999999e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  67.46 
 
 		 174 aa  246  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1713  intracellular protease, PfpI family  66.27 
 
 		 174 aa  239  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00460546  normal  0.198806 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  62.03 
 
 		 172 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  51.81 
 
 		 173 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1524  ThiJ/PfpI domain protein  56.17 
 
 		 180 aa  189  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.447561  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  44.58 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  45.24 
 
 		 227 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  46.95 
 
 		 168 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2580  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.67 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2403  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.09 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  43.29 
 
 		 170 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0105  ThiJ/PfpI domain protein  47.09 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438693  normal  0.815938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  47.24 
 
 		 166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  46.06 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  46.06 
 
 		 188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  41.72 
 
 		 170 aa  144  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1220  ThiJ/PfpI  45.51 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  45.45 
 
 		 188 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  45.96 
 
 		 167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  45.09 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  45.45 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  43.11 
 
 		 173 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  43.02 
 
 		 192 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  45.09 
 
 		 187 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  44.51 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  42.44 
 
 		 192 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  44.17 
 
 		 167 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  43.6 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  44.57 
 
 		 182 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  43.93 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  41.28 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  42.44 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  40.57 
 
 		 179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  42.61 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  43.43 
 
 		 182 aa  131  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1052  intracellular protease, PfpI family  38.41 
 
 		 167 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.426271  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  40.78 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  42.2 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  38.95 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  41.71 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  42.2 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  40.85 
 
 		 167 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  41.71 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  41.71 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  42.59 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  42.59 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  38.75 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  39.2 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  40.12 
 
 		 180 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  42.37 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  40.57 
 
 		 179 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  37.85 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  41.11 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  39.31 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  42.01 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  40.12 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2922  ThiJ/PfpI domain protein  38.36 
 
 		 167 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0699606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  42.2 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  37.65 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  38.29 
 
 		 183 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  41.81 
 
 		 189 aa  121  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  37.65 
 
 		 204 aa  121  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  40.23 
 
 		 186 aa  121  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  40.12 
 
 		 180 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  39.53 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  40.94 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  39.08 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  38.29 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  37.71 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  39.53 
 
 		 179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  40.7 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  42.2 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  37.8 
 
 		 364 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  37.29 
 
 		 364 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  37.5 
 
 		 168 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  39.18 
 
 		 179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  38.98 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  38.82 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  40.37 
 
 		 169 aa  118  6e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  39.53 
 
 		 183 aa  118  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  40.23 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  38.73 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  38.55 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  39.31 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  38.18 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  38.27 
 
 		 184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  42.69 
 
 		 193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  42.94 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  38.65 
 
 		 172 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  38.65 
 
 		 172 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  38.65 
 
 		 172 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  38.65 
 
 		 172 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  38.65 
 
 		 172 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  37.87 
 
 		 182 aa  116  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  38.73 
 
 		 188 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  38.6 
 
 		 177 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  38.04 
 
 		 172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>