More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0062 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  100 
 
 
169 aa  342  2e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  55.42 
 
 
166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  46.99 
 
 
167 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  44.31 
 
 
167 aa  158  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  45.18 
 
 
167 aa  158  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  44.38 
 
 
173 aa  149  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  42.17 
 
 
172 aa  144  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  41.57 
 
 
169 aa  143  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  41.57 
 
 
169 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  43.37 
 
 
166 aa  142  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  41.99 
 
 
187 aa  136  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  43.96 
 
 
191 aa  133  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  40.49 
 
 
168 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  41.86 
 
 
192 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  41.86 
 
 
192 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2996  PfpI family intracellular peptidase  38.8 
 
 
192 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0734954  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  41.28 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2318  ThiJ/PfpI domain protein  37.27 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  36.14 
 
 
170 aa  124  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2222  intracellular protease, PfpI family  35.96 
 
 
197 aa  124  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.648289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2009  intracellular protease, PfpI family  35.03 
 
 
198 aa  123  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2501  intracellular protease, PfpI family  36.46 
 
 
184 aa  121  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.248652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2231  intracellular protease, PfpI family  37.22 
 
 
183 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  35.33 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  39.51 
 
 
172 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2023  PfpI family intracellular peptidase  37.5 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.297632  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  40.96 
 
 
174 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  38.32 
 
 
186 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  41.21 
 
 
187 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3754  intracellular protease, PfpI family  35.52 
 
 
201 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0332  intracellular protease, PfpI family  34.78 
 
 
199 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  37.21 
 
 
190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  40.37 
 
 
204 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3045  PfpI family intracellular peptidase  32.78 
 
 
184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000681061  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  41.36 
 
 
173 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  38.82 
 
 
363 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  36.81 
 
 
170 aa  117  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3508  intracellular protease, PfpI family  33.86 
 
 
198 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2697  intracellular protease, PfpI family  34.25 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  0.0728869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  39.41 
 
 
189 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  38.69 
 
 
172 aa  115  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  38.69 
 
 
187 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2859  intracellular protease, PfpI family  33.16 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  37.65 
 
 
181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  41.78 
 
 
168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  40.12 
 
 
182 aa  114  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  37.06 
 
 
187 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  39.02 
 
 
184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0347  peptidase C56, PfpI  33.87 
 
 
192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1994  PfpI family intracellular peptidase  34.04 
 
 
204 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000215331  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2941  PfpI family intracellular peptidase  34.74 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161732  normal  0.711333 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0594  intracellular protease, PfpI family  41.36 
 
 
174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00956999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0362  peptidase C56, PfpI  33.16 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  35.98 
 
 
227 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1052  intracellular protease, PfpI family  40 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.426271  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  36.69 
 
 
190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  37.21 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1713  intracellular protease, PfpI family  38.61 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00460546  normal  0.198806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  37.43 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  38.73 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  37.5 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0363  intracellular protease, PfpI family  32.61 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0349  intracellular protease, PfpI family  34.43 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  38.55 
 
 
366 aa  112  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3237  intracellular protease, PfpI family  32.09 
 
 
200 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1742  PfpI family intracellular peptidase  34.78 
 
 
193 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.419318 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1389  PfpI family intracellular peptidase  34.43 
 
 
193 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0691524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0298  intracellular protease, PfpI family  32.45 
 
 
192 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  39.63 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  39.63 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  39.63 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  39.63 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  39.63 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  41.67 
 
 
204 aa  111  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  35.8 
 
 
168 aa  111  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  37.65 
 
 
183 aa  111  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  38.16 
 
 
188 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0310  peptidase C56, PfpI  32.11 
 
 
209 aa  110  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1373  intracellular protease, PfpI family  33.7 
 
 
184 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228619  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0271  intracellular protease, PfpI family  32.45 
 
 
192 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  39.63 
 
 
188 aa  110  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  39.63 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  39.63 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  39.63 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  39.63 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  39.63 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  38.41 
 
 
168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  39.63 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  39.63 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  39.63 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3803  intracellular protease, PfpI family  33.33 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  38.24 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37700  cysteine peptidase PfpI protein  37.21 
 
 
206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1994  PfpI family intracellular peptidase  31.55 
 
 
194 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.964546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  38.04 
 
 
364 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  37.42 
 
 
197 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  39.63 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  36.63 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3031  intracellular protease, PfpI family  35.11 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.719779 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  37.75 
 
 
188 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>